STRINGSTRING
PIIN_02608 PIIN_02608 PIIN_06897 PIIN_06897 PIIN_06814 PIIN_06814 PIIN_06751 PIIN_06751 PIIN_06687 PIIN_06687 PIIN_06698 PIIN_06698 PIIN_06695 PIIN_06695 PIIN_06582 PIIN_06582 PIIN_06570 PIIN_06570 PIIN_11787 PIIN_11787 SPB1 SPB1 PIIN_06143 PIIN_06143 PIIN_06111 PIIN_06111 PIIN_06083 PIIN_06083 PIIN_05939 PIIN_05939 PIIN_05714 PIIN_05714 PIIN_05711 PIIN_05711 PIIN_05678 PIIN_05678 PIIN_05653 PIIN_05653 PIIN_05650 PIIN_05650 PIIN_05599 PIIN_05599 PIIN_05598 PIIN_05598 PIIN_05579 PIIN_05579 PIIN_05523 PIIN_05523 PIIN_05488 PIIN_05488 PIIN_05463 PIIN_05463 PIIN_05395 PIIN_05395 PIIN_05392 PIIN_05392 PIIN_05182 PIIN_05182 PIIN_05181 PIIN_05181 PIIN_05180 PIIN_05180 PIIN_05178 PIIN_05178 PIIN_05172 PIIN_05172 PIIN_05085 PIIN_05085 PIIN_05069 PIIN_05069 PIIN_05058 PIIN_05058 PIIN_04907 PIIN_04907 PIIN_04897 PIIN_04897 PIIN_04892 PIIN_04892 PIIN_04875 PIIN_04875 PIIN_04868 PIIN_04868 PIIN_04796 PIIN_04796 PIIN_04759 PIIN_04759 PIIN_04754 PIIN_04754 PIIN_04590 PIIN_04590 PIIN_04537 PIIN_04537 PIIN_04549 PIIN_04549 PIIN_04548 PIIN_04548 PIIN_04489 PIIN_04489 PIIN_04325 PIIN_04325 PIIN_04322 PIIN_04322 PIIN_04292 PIIN_04292 PIIN_04311 PIIN_04311 PIIN_04309 PIIN_04309 PIIN_04276 PIIN_04276 PIIN_04271 PIIN_04271 PIIN_04245 PIIN_04245 PIIN_04246 PIIN_04246 PIIN_04186 PIIN_04186 PIIN_04185 PIIN_04185 PIIN_04149 PIIN_04149 PIIN_04072 PIIN_04072 PIIN_04085 PIIN_04085 PIIN_04008 PIIN_04008 NAT10 NAT10 PIIN_03751 PIIN_03751 PIIN_11851 PIIN_11851 PIIN_03698 PIIN_03698 PIIN_03613 PIIN_03613 PIIN_03596 PIIN_03596 PIIN_03616 PIIN_03616 PIIN_03557 PIIN_03557 PIIN_03498 PIIN_03498 ERB1 ERB1 PIIN_03331 PIIN_03331 PIIN_03305 PIIN_03305 PIIN_03274 PIIN_03274 PIIN_03261 PIIN_03261 PIIN_03268 PIIN_03268 PIIN_03224 PIIN_03224 PIIN_03162 PIIN_03162 PIIN_03183 PIIN_03183 PIIN_03192 PIIN_03192 PIIN_03135 PIIN_03135 PIIN_03115 PIIN_03115 PIIN_03066 PIIN_03066 PIIN_02913 PIIN_02913 PIIN_02883 PIIN_02883 PIIN_02874 PIIN_02874 PIIN_02785 PIIN_02785 PIIN_02737 PIIN_02737 PIIN_02721 PIIN_02721 PIIN_02714 PIIN_02714 PIIN_02675 PIIN_02675 PIIN_02500 PIIN_02500 PIIN_02501 PIIN_02501 PIIN_02574 PIIN_02574 PIIN_00656 PIIN_00656 PIIN_00691 PIIN_00691 PIIN_11712 PIIN_11712 PIIN_00543 PIIN_00543 PIIN_03443 PIIN_03443 PIIN_02980 PIIN_02980 PIIN_02972 PIIN_02972 PIIN_11501 PIIN_11501 PIIN_11445 PIIN_11445 PIIN_11436 PIIN_11436 PIIN_11406 PIIN_11406 PIIN_11362 PIIN_11362 PIIN_11260 PIIN_11260 PIIN_11111 PIIN_11111 PIIN_11037 PIIN_11037 PIIN_10987 PIIN_10987 PIIN_10830 PIIN_10830 PIIN_10793 PIIN_10793 PIIN_10771 PIIN_10771 PIIN_10667 PIIN_10667 PIIN_10578 PIIN_10578 PIIN_10405 PIIN_10405 PIIN_10320 PIIN_10320 PIIN_10228 PIIN_10228 PIIN_11802 PIIN_11802 PIIN_10059 PIIN_10059 PIIN_10017 PIIN_10017 PIIN_09993 PIIN_09993 PIIN_09917 PIIN_09917 PIIN_09905 PIIN_09905 PIIN_09880 PIIN_09880 PIIN_11743 PIIN_11743 PIIN_09725 PIIN_09725 PIIN_09720 PIIN_09720 PIIN_09707 PIIN_09707 PIIN_09660 PIIN_09660 PIIN_09618 PIIN_09618 PIIN_09605 PIIN_09605 PIIN_09545 PIIN_09545 PIIN_09538 PIIN_09538 PIIN_09533 PIIN_09533 PIIN_09508 PIIN_09508 PIIN_09443 PIIN_09443 PIIN_09427 PIIN_09427 PIIN_09425 PIIN_09425 PIIN_09343 PIIN_09343 PIIN_09283 PIIN_09283 PIIN_09263 PIIN_09263 PIIN_09229 PIIN_09229 PIIN_09202 PIIN_09202 PIIN_09184 PIIN_09184 PIIN_09183 PIIN_09183 PIIN_11885 PIIN_11885 PIIN_09052 PIIN_09052 PIIN_09003 PIIN_09003 PIIN_08995 PIIN_08995 LSM5 LSM5 PIIN_08954 PIIN_08954 PIIN_08877 PIIN_08877 PIIN_08860 PIIN_08860 PIIN_08799 PIIN_08799 PIIN_08475 PIIN_08475 PIIN_08452 PIIN_08452 PIIN_08434 PIIN_08434 PIIN_08416 PIIN_08416 PIIN_08299 PIIN_08299 PIIN_08291 PIIN_08291 PIIN_08213 PIIN_08213 PIIN_08181 PIIN_08181 PIIN_08145 PIIN_08145 PIIN_08075 PIIN_08075 PIIN_08069 PIIN_08069 PIIN_07907 PIIN_07907 PIIN_07854 PIIN_07854 PIIN_07833 PIIN_07833 PIIN_07827 PIIN_07827 PIIN_07799 PIIN_07799 PIIN_07761 PIIN_07761 PIIN_07742 PIIN_07742 LSM4 LSM4 PIIN_07712 PIIN_07712 PIIN_07617 PIIN_07617 PIIN_07600 PIIN_07600 PIIN_07583 PIIN_07583 PIIN_07581 PIIN_07581 PIIN_07573 PIIN_07573 PIIN_07486 PIIN_07486 PIIN_07393 PIIN_07393 PIIN_07382 PIIN_07382 PIIN_07362 PIIN_07362 PIIN_07355 PIIN_07355 PIIN_07306 PIIN_07306 PIIN_07277 PIIN_07277 PIIN_07272 PIIN_07272 PIIN_07230 PIIN_07230 PIIN_07179 PIIN_07179 PIIN_07174 PIIN_07174 PIIN_07060 PIIN_07060 PIIN_07050 PIIN_07050 PIIN_07036 PIIN_07036 PIIN_01228 PIIN_01228 PIIN_01226 PIIN_01226 PIIN_11675 PIIN_11675 PIIN_01163 PIIN_01163 PIIN_01117 PIIN_01117 PIIN_01104 PIIN_01104 PIIN_01059 PIIN_01059 PIIN_00986 PIIN_00986 PIIN_01032 PIIN_01032 PIIN_00984 PIIN_00984 PIIN_00885 PIIN_00885 PIIN_00849 PIIN_00849 PIIN_00831 PIIN_00831 PIIN_00779 PIIN_00779 PIIN_00736 PIIN_00736 PIIN_07022 PIIN_07022 PIIN_00729 PIIN_00729 PIIN_00606 PIIN_00606 PIIN_00460 PIIN_00460 PIIN_00395 PIIN_00395 PIIN_00372 PIIN_00372 PIIN_00342 PIIN_00342 TIF6 TIF6 LSM3 LSM3 PIIN_00287 PIIN_00287 PIIN_11704 PIIN_11704 PIIN_00244 PIIN_00244 PIIN_00236 PIIN_00236 PIIN_00222 PIIN_00222 PIIN_00213 PIIN_00213 PIIN_00160 PIIN_00160 PIIN_00165 PIIN_00165 PIIN_00010 PIIN_00010 PIIN_02603 PIIN_02603 PIIN_01213 PIIN_01213 PIIN_01284 PIIN_01284 PIIN_01299 PIIN_01299 PIIN_01260 PIIN_01260 PIIN_01290 PIIN_01290 PIIN_11757 PIIN_11757 PIIN_01330 PIIN_01330 PIIN_01336 PIIN_01336 PIIN_01351 PIIN_01351 PIIN_01440 PIIN_01440 PIIN_01517 PIIN_01517 PIIN_01513 PIIN_01513 PIIN_01542 PIIN_01542 PIIN_01581 PIIN_01581 PIIN_01598 PIIN_01598 PIIN_01591 PIIN_01591 PIIN_01597 PIIN_01597 PIIN_01645 PIIN_01645 FEN1 FEN1 PIIN_01649 PIIN_01649 PIIN_01654 PIIN_01654 PIIN_01674 PIIN_01674 PIIN_01705 PIIN_01705 PIIN_01682 PIIN_01682 PIIN_01695 PIIN_01695 PIIN_01711 PIIN_01711 PIIN_01888 PIIN_01888 PIIN_02064 PIIN_02064 PIIN_02150 PIIN_02150 PIIN_02154 PIIN_02154 PIIN_02182 PIIN_02182 PIIN_02188 PIIN_02188 PIIN_02244 PIIN_02244 PIIN_02255 PIIN_02255 PIIN_02252 PIIN_02252 PIIN_02367 PIIN_02367 PIIN_02358 PIIN_02358 PIIN_02398 PIIN_02398 PIIN_02405 PIIN_02405 PIIN_02406 PIIN_02406 PIIN_02408 PIIN_02408
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
PIIN_02608Related to MAK11 protein (Maintenance of killer toxin-encoding satellite M1 dsRNA). (433 aa)
PIIN_06897Ribosome biogenesis protein NOP53; May play a role in ribosome biogenesis. Belongs to the NOP53 family. (435 aa)
PIIN_06814Probable DIS3 3`-5` exoribonuclease required for 3` end formation of 5.8S rRNA; Belongs to the RNR ribonuclease family. (1006 aa)
PIIN_06751DNA-directed RNA polymerase subunit; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. (1755 aa)
PIIN_06687Related to HDA1-histone deacetylase A. (698 aa)
PIIN_06698Uncharacterized protein. (377 aa)
PIIN_06695annotation not available (196 aa)
PIIN_06582RNA helicase. (769 aa)
PIIN_06570Related to WD-repeat protein, putative-Talaromyces stipitatus. (1547 aa)
PIIN_11787WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (701 aa)
SPB1AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1; Required for proper assembly of pre-ribosomal particles during the biogenesis of the 60S ribosomal subunit; Belongs to the class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. RNA methyltransferase RlmE family. SPB1 subfamily. (1111 aa)
PIIN_06143annotation not available (511 aa)
PIIN_06111DRIM domain-containing protein. (2573 aa)
PIIN_06083Related to RCL1-RNA terminal phosphate cyclase-like protein. (355 aa)
PIIN_05939Related to UTP4-U3 snoRNP protein. (806 aa)
PIIN_05714DNA topoisomerase I; Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. Introduces a single-strand break via transesterification at the specific target site 5'-[CT]CCTTp site in duplex DNA. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(3'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 5'-OH DNA strand. The free DNA strand then undergoes passage around the unbroken strand thus r [...] (905 aa)
PIIN_05711U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (94 aa)
PIIN_05678Related to IME4-positive transcription factor for IME2; Belongs to the MT-A70-like family. (559 aa)
PIIN_05653Probable periodic tryptophan protein PWP2. (909 aa)
PIIN_05650Probable RPA135-DNA-directed RNA polymerase I, 135 KD subunit. (410 aa)
PIIN_05599Uncharacterized protein. (282 aa)
PIIN_05598Uncharacterized protein. (252 aa)
PIIN_05579WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1141 aa)
PIIN_05523PINc domain-containing protein. (1138 aa)
PIIN_05488DUF2470 domain-containing protein. (225 aa)
PIIN_05463Related to rRNA-processing protein EFG1-Coprinopsis cinerea. (260 aa)
PIIN_05395WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1813 aa)
PIIN_05392Related to DBP6-ATP-dependent RNA helicase. (1596 aa)
PIIN_05182WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1006 aa)
PIIN_05181Probable NOP58-required for pre-18S rRNA processing. (587 aa)
PIIN_05180KRR1 small subunit processome component; Required for 40S ribosome biogenesis. Involved in nucleolar processing of pre-18S ribosomal RNA and ribosome assembly. (350 aa)
PIIN_05178Related to ENP1-required for pre-rRNA processing and 40S ribosomal subunit synthesis. (463 aa)
PIIN_05172Uncharacterized protein. (648 aa)
PIIN_05085Uncharacterized protein. (657 aa)
PIIN_05069Related to Streptococcus M protein. (662 aa)
PIIN_05058Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (772 aa)
PIIN_04907RRM domain-containing protein. (627 aa)
PIIN_04897Probable branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase e1-beta subunit. (433 aa)
PIIN_04892Uncharacterized protein. (484 aa)
PIIN_04875Related to Exosome complex exonuclease RRP43. (279 aa)
PIIN_04868Uncharacterized protein. (312 aa)
PIIN_04796Uncharacterized protein. (88 aa)
PIIN_04759Related to EBP2-required for pre-rRNA processing and ribosomal subunit assembly. (390 aa)
PIIN_04754Related to ECM16-putative DEAH-box RNA helicase. (1200 aa)
PIIN_04590Probable MTR4-involved in nucleocytoplasmic transport of mRNA. (1010 aa)
PIIN_04537Related to DIP2-Dom34p-interacting protein. (912 aa)
PIIN_04549Related to histone deacetylase superfamily-Chloroflexus aggregans DSM 9485. (392 aa)
PIIN_04548WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1443 aa)
PIIN_04489Uncharacterized protein. (214 aa)
PIIN_04325DUF862 domain-containing protein. (210 aa)
PIIN_04322Uncharacterized protein. (626 aa)
PIIN_04292RNA_pol_L_2 domain-containing protein. (97 aa)
PIIN_04311WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (983 aa)
PIIN_04309Probable RNA-binding protein. (799 aa)
PIIN_04276WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1291 aa)
PIIN_04271Kri1_C domain-containing protein. (690 aa)
PIIN_04245Fcf2 domain-containing protein. (265 aa)
PIIN_04246Related to microtubule binding protein YTM1-Laccaria bicolor. (215 aa)
PIIN_0418620S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1; Required for the synthesis of 40S ribosome subunits. Has a role in processing 20S pre-rRNA into the mature 18S rRNA, where it is required for cleavage at the 3' end of the mature 18S rRNA (D-site). Accompanies the 20S pre-rRNA from the nucleus to the cytoplasm. Belongs to the NOB1 family. (439 aa)
PIIN_04185Related to RRN3-RNA polymerase I specific transcription factor. (854 aa)
PIIN_04149Related to protein RPF2 involved in ribosomal large subunit assembly and maintenance. (356 aa)
PIIN_04072U3 small nucleolar RNA-associated protein 25; DEAD-box RNA helicase-like protein required for pre-18S rRNA processing, specifically at sites A0, A1, and A2. (623 aa)
PIIN_04085DUF2431 domain-containing protein. (282 aa)
PIIN_04008Related to UTP6-U3 snoRNP protein. (654 aa)
NAT10RNA cytidine acetyltransferase; RNA cytidine acetyltransferase with specificity toward both 18S rRNA and tRNAs. Catalyzes the formation of N(4)-acetylcytidine (ac4C) in 18S rRNA. Required for early nucleolar cleavages of precursor rRNA at sites A0, A1 and A2 during 18S rRNA synthesis. Catalyzes the formation of ac4C in serine and leucine tRNAs. Requires the tRNA- binding adapter protein TAN1 for full tRNA acetyltransferase activity but not for 18S rRNA acetylation. (1111 aa)
PIIN_03751Uncharacterized protein. (967 aa)
PIIN_11851Probable BUD23-Protein involved in bud-site selection. (283 aa)
PIIN_03698Probable RRP45-Exosome complex exonuclease. (313 aa)
PIIN_03613Related to BRX1-Essential nucleolar protein required for biogenesis of the 60S ribosomal subunit. (319 aa)
PIIN_03596Related to S. pombe beta-transducin. (955 aa)
PIIN_03616Related to Ribonuclease P protein subunit p30. (325 aa)
PIIN_03557Related to RRP9-protein associated with the U3 small nucleolar RNA. (560 aa)
PIIN_03498Uncharacterized protein. (745 aa)
ERB1Ribosome biogenesis protein ERB1; Component of the NOP7 complex, which is required for maturation of the 25S and 5.8S ribosomal RNAs and formation of the 60S ribosome. (757 aa)
PIIN_03331Uncharacterized protein. (614 aa)
PIIN_03305Poly [ADP-ribose] polymerase. (603 aa)
PIIN_03274G-patch domain-containing protein. (383 aa)
PIIN_03261Related to NOL1R protein; Belongs to the class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. RsmB/NOP family. (474 aa)
PIIN_03268Uncharacterized protein. (412 aa)
PIIN_03224Related to NOC2-Crucial for intranuclear movement of ribosomal particles. (725 aa)
PIIN_03162Related to DNA polymerase V. (1180 aa)
PIIN_03183Probable protein kinase CK2 alpha subunit; Belongs to the protein kinase superfamily. (335 aa)
PIIN_03192Probable ROK1-ATP-dependent RNA helicase; Belongs to the DEAD box helicase family. (561 aa)
PIIN_03135Probable NOP2-nucleolar protein; Belongs to the class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. RsmB/NOP family. (683 aa)
PIIN_03115Uncharacterized protein. (446 aa)
PIIN_03066Related to DRS1-RNA helicase of the DEAD box family; Belongs to the DEAD box helicase family. (767 aa)
PIIN_02913WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (941 aa)
PIIN_02883FCP1 homology domain-containing protein. (212 aa)
PIIN_02874Uncharacterized protein. (192 aa)
PIIN_02785RNase_PH domain-containing protein. (333 aa)
PIIN_02737Probable 25 kD subunit of DNA-directed RNA polymerases I, II and III. (211 aa)
PIIN_02721Related to predicted actin-bundling protein-Laccaria bicolor. (277 aa)
PIIN_02714Probable PNO1 protein. (317 aa)
PIIN_02675WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (591 aa)
PIIN_02500Uncharacterized protein. (257 aa)
PIIN_02501Uncharacterized protein. (131 aa)
PIIN_02574Probable UAF30-subunit of RNA polymerase I transcription factor. (295 aa)
PIIN_00656Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1225 aa)
PIIN_00691RNA helicase. (559 aa)
PIIN_11712Related to RPF1-involved in the assembly of the large ribosomal subunit. (347 aa)
PIIN_00543Smr domain-containing protein. (545 aa)
PIIN_03443Nucleolar complex-associated protein 3; Required for synthesis of 60S ribosomal subunits and the transport of pre-ribosomes from the nucleoplasm to the cytoplasm. Belongs to the CBF/MAK21 family. (787 aa)
PIIN_02980Related to MAK21-protein required for 60S ribosomal subunit biogenesis. (1037 aa)
PIIN_02972RRM domain-containing protein. (460 aa)
PIIN_11501Related to MPP10-component of the U3 small nucleolar ribonucleoprotein. (202 aa)
PIIN_11445WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (226 aa)
PIIN_11436Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (141 aa)
PIIN_11406Uncharacterized protein. (130 aa)
PIIN_11362Uncharacterized protein. (317 aa)
PIIN_11260Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (310 aa)
PIIN_11111Related to TSR1-protein involved in 20S rRNA accumulation. (157 aa)
PIIN_11037Probable RPA135-DNA-directed RNA polymerase I, 135 KD subunit; Belongs to the RNA polymerase beta chain family. (268 aa)
PIIN_10987WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (400 aa)
PIIN_10830WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (198 aa)
PIIN_10793Related to TSR1-protein involved in 20S rRNA accumulation. (372 aa)
PIIN_10771Sof1 domain-containing protein. (61 aa)
PIIN_10667WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (562 aa)
PIIN_10578WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (158 aa)
PIIN_10405WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (952 aa)
PIIN_10320Related to NOP14-nuclear and nucleolar protein with possible role in ribosome biogenesis. (684 aa)
PIIN_10228Dimer_Tnp_hAT domain-containing protein. (745 aa)
PIIN_11802Related to pescadillo development protein. (452 aa)
PIIN_10059Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (340 aa)
PIIN_10017Casein kinase II subunit beta; Plays a complex role in regulating the basal catalytic activity of the alpha subunit; Belongs to the casein kinase 2 subunit beta family. (497 aa)
PIIN_09993Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1234 aa)
PIIN_09917WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (157 aa)
PIIN_09905Related to cgi-94 protein. (319 aa)
PIIN_09880WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (240 aa)
PIIN_11743Probable Rpc11-DNA-directed RNA polymerase III subunit C11. (98 aa)
PIIN_09725Uncharacterized protein. (775 aa)
PIIN_09720Uncharacterized protein. (1342 aa)
PIIN_09707Probable translation initiation factor eIF-4A, exon junction complex; Belongs to the DEAD box helicase family. (397 aa)
PIIN_09660BTB domain-containing protein. (563 aa)
PIIN_09618Related to NOP14-nuclear and nucleolar protein with possible role in ribosome biogenesis. (221 aa)
PIIN_09605Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (240 aa)
PIIN_09545Uncharacterized protein. (1266 aa)
PIIN_09538Probable Rpo26-18kD subunit of DNA-directed RNA polymerases I, II, III. (164 aa)
PIIN_09533Related to RRP40-protein involved in ribosomal RNA processing, component of the exosome complex. (230 aa)
PIIN_09508Ribosome assembly factor mrt4; Component of the ribosome assembly machinery. Nuclear paralog of the ribosomal protein P0, it binds pre-60S subunits at an early stage of assembly in the nucleolus, and is replaced by P0 in cytoplasmic pre-60S subunits and mature 80S ribosomes. (258 aa)
PIIN_09443Related to TSR1-protein involved in 20S rRNA accumulation. (673 aa)
PIIN_09427WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (375 aa)
PIIN_09425Probable ATP dependent RNA helicase. (705 aa)
PIIN_09343annotation not available (702 aa)
PIIN_09283rRNA-processing protein; Involved in nucleolar integrity and required for processing of the pre-rRNA for the 60S ribosome subunit. Belongs to the CGR1 family. (117 aa)
PIIN_09263Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1531 aa)
PIIN_09229Related to nucleolar 100K polymyositis-scleroderma protein. (847 aa)
PIIN_09202Ribonuclease P protein subunit. (254 aa)
PIIN_09184Uncharacterized protein. (435 aa)
PIIN_09183RNase III domain-containing protein. (144 aa)
PIIN_11885WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (111 aa)
PIIN_09052Related to UTP18-Possible U3 snoRNP protein involved in maturation of pre-18S rRNA. (542 aa)
PIIN_09003Related to proteophosphoglycan 5-Leishmania major strain Friedlin. (1317 aa)
PIIN_08995Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1498 aa)
LSM5U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5; Plays a role in U6 snRNP assembly and function. Binds to the 3' end of U6 snRNA. (84 aa)
PIIN_08954Related to RNA-binding protein rnp24. (390 aa)
PIIN_08877Ribonucloprotein; Common component of the spliceosome and rRNA processing machinery; Belongs to the eukaryotic ribosomal protein eL8 family. (191 aa)
PIIN_08860Probable 40s ribosomal protein S13.e; Belongs to the universal ribosomal protein uS15 family. (166 aa)
PIIN_08799Uncharacterized protein. (795 aa)
PIIN_08475Uncharacterized protein. (463 aa)
PIIN_08452Uncharacterized protein. (915 aa)
PIIN_08434Probable CBF5-Centromere Binding Factor / putative rRNA pseuduridine synthase. (532 aa)
PIIN_08416Related to UTP7-U3 snoRNP protein. (623 aa)
PIIN_08299Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (471 aa)
PIIN_08291Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (536 aa)
PIIN_08213WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (174 aa)
PIIN_08181Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1263 aa)
PIIN_08145Probable SIK1-involved in pre-rRNA processing. (526 aa)
PIIN_08075WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (1189 aa)
PIIN_08069H/ACA ribonucleoprotein complex subunit; Required for ribosome biogenesis. Part of a complex which catalyzes pseudouridylation of rRNA. This involves the isomerization of uridine such that the ribose is subsequently attached to C5, instead of the normal N1. Pseudouridine ("psi") residues may serve to stabilize the conformation of rRNAs. (280 aa)
PIIN_07907Related to Pwp2p. (524 aa)
PIIN_07854Related to DBP3-Putative RNA helicase required for pre-rRNA processing; Belongs to the DEAD box helicase family. (556 aa)
PIIN_07833Probable DNA-directed RNA polymerase II 14.5 kDa polypeptide; Belongs to the archaeal rpoM/eukaryotic RPA12/RPB9/RPC11 RNA polymerase family. (131 aa)
PIIN_07827tRNA dimethylallyltransferase. (475 aa)
PIIN_07799Checkpoint protein; Belongs to the HUS1 family. (290 aa)
PIIN_07761Probable IMP3-component of the U3 small nucleolar ribonucleoprotein. (182 aa)
PIIN_07742Related to SRP40-Suppressor of mutant AC40 of RNA polymerase I and III. (350 aa)
LSM4U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (126 aa)
PIIN_07712WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (816 aa)
PIIN_07617Probable RPA135-DNA-directed RNA polymerase I, 135 KD subunit; Belongs to the RNA polymerase beta chain family. (528 aa)
PIIN_07600Related to ESF2-Eighteen S rRNA processing Factor. (204 aa)
PIIN_07583Related to UTP13-U3 snoRNP protein. (837 aa)
PIIN_07581Nucleolar GTP-binding protein 2; GTPase that associates with pre-60S ribosomal subunits in the nucleolus and is required for their nuclear export and maturation. Belongs to the TRAFAC class YlqF/YawG GTPase family. NOG2 subfamily. (550 aa)
PIIN_07573Related to WD40-repeat protein (Notchless protein). (1358 aa)
PIIN_07486RNase_PH domain-containing protein. (244 aa)
PIIN_07393Related to NUG1-Nuclear GTPase (Involved in Ribosome biogenesis). (548 aa)
PIIN_07382Related to NSR1-nuclear localization sequence binding protein. (657 aa)
PIIN_07362Probable DEAD box protein (Putative RNA helicase); Belongs to the DEAD box helicase family. (458 aa)
PIIN_07355Probable Rpc40-40 kD subunit of DNA-directed RNA polymerases I and III. (382 aa)
PIIN_07306Related to TRF4-topoisomerase I-related protein. (628 aa)
PIIN_07277Uncharacterized protein. (295 aa)
PIIN_07272Probable BMS1-GTP-binding protein, required for distinct steps of 40S ribosome biogenesis. (901 aa)
PIIN_07230Signal recognition particle subunit SRP68; Signal-recognition-particle assembly has a crucial role in targeting secretory proteins to the rough endoplasmic reticulum membrane; Belongs to the SRP68 family. (636 aa)
PIIN_07179Nucleolar GTP-binding protein 1; Involved in the biogenesis of the 60S ribosomal subunit. Belongs to the TRAFAC class OBG-HflX-like GTPase superfamily. OBG GTPase family. NOG subfamily. (666 aa)
PIIN_07174Probable NSA2-involved in biogenesis of ribosomal large subunit. (219 aa)
PIIN_07060Related to SOF1-involved in 18S pre-rRNA production. (475 aa)
PIIN_07050Uncharacterized protein. (887 aa)
PIIN_07036RNase_PH domain-containing protein. (267 aa)
PIIN_01228Uncharacterized protein. (388 aa)
PIIN_01226PUM-HD domain-containing protein. (653 aa)
PIIN_11675Condensin complex subunit 1; Regulatory subunit of the condensin complex, a complex required for conversion of interphase chromatin into mitotic-like condense chromosomes. The condensin complex probably introduces positive supercoils into relaxed DNA in the presence of type I topoisomerases and converts nicked DNA into positive knotted forms in the presence of type II topoisomerases. (1430 aa)
PIIN_01163Related to NOC4-ribosome biogenesis protein. (564 aa)
PIIN_01117Uncharacterized protein. (121 aa)
PIIN_01104Uncharacterized protein. (72 aa)
PIIN_01059Related to CTK1-carboxy-terminal domain (CTD) kinase, alpha subunit. (1022 aa)
PIIN_00986CutC domain-containing protein. (114 aa)
PIIN_01032Related to SSF1-nucleolar protein involved in the assembly of the large ribosomal subunit. (404 aa)
PIIN_00984Related to NOP6-protein with possible role in rRNA processing. (298 aa)
PIIN_00885Related to NOP15-protein involved in 60S ribosomal subunit biogenesis. (360 aa)
PIIN_00849Related to CDC14-dual specificity phosphatase. (690 aa)
PIIN_00831Protein SDA1; Required for 60S pre-ribosomal subunits export to the cytoplasm; Belongs to the SDA1 family. (757 aa)
PIIN_00779Related to PITSLRE protein kinase isoforms. (375 aa)
PIIN_00736Related to LCP5-U3 small nucleolar ribonucleoprotein involved in maturation of 18S rRNA. (365 aa)
PIIN_07022ATP-dependent RNA helicase DBP10. (955 aa)
PIIN_00729RNA helicase. (641 aa)
PIIN_00606Midasin; Nuclear chaperone required for maturation and nuclear export of pre-60S ribosome subunits; Belongs to the midasin family. (4811 aa)
PIIN_00460Protein MAK16; Belongs to the MAK16 family. (325 aa)
PIIN_00395Uncharacterized protein. (449 aa)
PIIN_00372Uncharacterized protein. (707 aa)
PIIN_00342Probable exosome complex exonuclease rrp41. (277 aa)
TIF6Eukaryotic translation initiation factor 6; Binds to the 60S ribosomal subunit and prevents its association with the 40S ribosomal subunit to form the 80S initiation complex in the cytoplasm. Is also involved in ribosome biogenesis. Associates with pre-60S subunits in the nucleus and is involved in its nuclear export; Belongs to the eIF-6 family. (245 aa)
LSM3U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (94 aa)
PIIN_00287Related to ATP-dependent helicase involved in rRNA processing; Belongs to the DEAD box helicase family. (571 aa)
PIIN_11704Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase. (701 aa)
PIIN_00244Related to PCH2-putative ATPase. (473 aa)
PIIN_00236Rsa3 domain-containing protein. (93 aa)
PIIN_00222Probable NOP10-nucleolar rRNA processing protein. (61 aa)
PIIN_00213RRM domain-containing protein. (328 aa)
PIIN_00160BP28CT domain-containing protein. (1961 aa)
PIIN_00165Uncharacterized protein. (420 aa)
PIIN_00010Probable IMP4-component of the U3 small nucleolar ribonucleoprotein. (288 aa)
PIIN_02603Uncharacterized protein. (291 aa)
PIIN_01213U3 small nucleolar RNA-associated protein 22. (1221 aa)
PIIN_01284Related to MNR2-Manganese resistance protein. (739 aa)
PIIN_01299U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein MPP10; Involved in nucleolar processing of pre-18S ribosomal RNA. Belongs to the MPP10 family. (627 aa)
PIIN_01260annotation not available (272 aa)
PIIN_01290CLP1_P domain-containing protein. (681 aa)
PIIN_11757Uncharacterized protein. (205 aa)
PIIN_01330Related to RLP24-Ribosomal Like Protein 24, part of a pre-60S complex. (210 aa)
PIIN_01336Probable NOP1-fibrillarin. (309 aa)
PIIN_01351Casein kinase II subunit beta; Plays a complex role in regulating the basal catalytic activity of the alpha subunit; Belongs to the casein kinase 2 subunit beta family. (280 aa)
PIIN_01440Uncharacterized protein. (612 aa)
PIIN_01517Uncharacterized protein. (125 aa)
PIIN_01513Uncharacterized protein. (564 aa)
PIIN_01542DNA-directed RNA polymerase subunit; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Belongs to the archaeal rpoM/eukaryotic RPA12/RPB9/RPC11 RNA polymerase family. (127 aa)
PIIN_01581Related to TGS1-TrimethylGuanosine Synthase. (336 aa)
PIIN_01598NopRA1 domain-containing protein. (353 aa)
PIIN_01591CENP-C_C domain-containing protein. (760 aa)
PIIN_01597Npa1 domain-containing protein. (1085 aa)
PIIN_01645Uncharacterized protein. (739 aa)
FEN1Flap endonuclease 1; Structure-specific nuclease with 5'-flap endonuclease and 5'- 3' exonuclease activities involved in DNA replication and repair. During DNA replication, cleaves the 5'-overhanging flap structure that is generated by displacement synthesis when DNA polymerase encounters the 5'-end of a downstream Okazaki fragment. It enters the flap from the 5'-end and then tracks to cleave the flap base, leaving a nick for ligation. Also involved in the long patch base excision repair (LP-BER) pathway, by cleaving within the apurinic/apyrimidinic (AP) site- terminated flap. Acts as [...] (366 aa)
PIIN_01649Related to osmosensing protein SGD1. (842 aa)
PIIN_01654Related to SAS10-involved in silencing. (677 aa)
PIIN_01674Related to CSL4-exosome core component. (211 aa)
PIIN_01705Related to MAK5-ATP-dependent RNA helicase; Belongs to the DEAD box helicase family. (703 aa)
PIIN_01682Probable ZUO1-zuotin. (385 aa)
PIIN_0169560S ribosome subunit biogenesis protein NIP7; Required for proper 27S pre-rRNA processing and 60S ribosome subunit assembly; Belongs to the NIP7 family. (180 aa)
PIIN_01711Related to RRP4-3`-5` exoribonuclease. (311 aa)
PIIN_01888Related to RRB1-involved in the regulation of ribosome biosynthesis. (533 aa)
PIIN_02064annotation not available (760 aa)
PIIN_02150annotation not available (735 aa)
PIIN_02154FK506-binding protein. (405 aa)
PIIN_02182RNA helicase. (793 aa)
PIIN_02188RPA43_OB domain-containing protein. (250 aa)
PIIN_02244Smg4_UPF3 domain-containing protein. (107 aa)
PIIN_02255Ribonucloprotein; Common component of the spliceosome and rRNA processing machinery; Belongs to the eukaryotic ribosomal protein eL8 family. (126 aa)
PIIN_02252Related to WD repeat-containing protein JIP5-Cryptococcus neoformans. (420 aa)
PIIN_02367Uncharacterized protein. (333 aa)
PIIN_02358Related to EMG1-Protein required for ribosome biogenesis. (348 aa)
PIIN_02398Related to RRP5-processing of pre-ribosomal RNA. (1501 aa)
PIIN_02405Uncharacterized protein. (286 aa)
PIIN_02406Uncharacterized protein. (527 aa)
PIIN_02408Uncharacterized protein. (450 aa)
Your Current Organism:
Serendipita indica
NCBI taxonomy Id: 1109443
Other names: Piriformospora indica DSM 11827, S. indica DSM 11827, Serendipita indica DSM 11827
Server load: low (28%) [HD]