STRINGSTRING
PIIN_10750 PIIN_10750 PIIN_10542 PIIN_10542 PIIN_10422 PIIN_10422 PIIN_10412 PIIN_10412 PIIN_10301 PIIN_10301 PIIN_10077 PIIN_10077 PIIN_10076 PIIN_10076 PIIN_10064 PIIN_10064 PIIN_10035 PIIN_10035 PIIN_09989 PIIN_09989 PIIN_09940 PIIN_09940 PIIN_05582 PIIN_05582 PIIN_05529 PIIN_05529 PIIN_05491 PIIN_05491 PIIN_05449 PIIN_05449 PIIN_05349 PIIN_05349 PIIN_00026 PIIN_00026 PIIN_00467 PIIN_00467 PIIN_00564 PIIN_00564 PIIN_00835 PIIN_00835 PIIN_01182 PIIN_01182 PIIN_01483 PIIN_01483 PIIN_01488 PIIN_01488 PIIN_01515 PIIN_01515 PIIN_01808 PIIN_01808 PIIN_01770 PIIN_01770 PIIN_02455 PIIN_02455 PIIN_02460 PIIN_02460 PIIN_02592 PIIN_02592 PIIN_03177 PIIN_03177 PIIN_03305 PIIN_03305 PIIN_03333 PIIN_03333 PIIN_05113 PIIN_05113 PIIN_05020 PIIN_05020 PIIN_04773 PIIN_04773 PIIN_04709 PIIN_04709 PIIN_04702 PIIN_04702 PIIN_04681 PIIN_04681 PIIN_04265 PIIN_04265 PIIN_03897 PIIN_03897 PIIN_03896 PIIN_03896 PIIN_03632 PIIN_03632 PIIN_09876 PIIN_09876 PIIN_09793 PIIN_09793 PIIN_09621 PIIN_09621 PIIN_09545 PIIN_09545 PIIN_09311 PIIN_09311 PIIN_09278 PIIN_09278 PIIN_09173 PIIN_09173 PIIN_08785 PIIN_08785 PIIN_08772 PIIN_08772 PIIN_08760 PIIN_08760 PIIN_08759 PIIN_08759 PIIN_08677 PIIN_08677 PIIN_08112 PIIN_08112 PIIN_08046 PIIN_08046 PIIN_07656 PIIN_07656 PIIN_07498 PIIN_07498 PIIN_07217 PIIN_07217 PIIN_07134 PIIN_07134 PIIN_06794 PIIN_06794 PIIN_06685 PIIN_06685 PIIN_06447 PIIN_06447 PIIN_01755 PIIN_01755 PIIN_01729 PIIN_01729 PIIN_00555 PIIN_00555 PIIN_00528 PIIN_00528 PIIN_03426 PIIN_03426 PIIN_11537 PIIN_11537 PIIN_11376 PIIN_11376 PIIN_11293 PIIN_11293 PIIN_11903 PIIN_11903 PIIN_11126 PIIN_11126 PIIN_10866 PIIN_10866 PIIN_10854 PIIN_10854
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
PIIN_10750Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (331 aa)
PIIN_10542Integrase catalytic domain-containing protein. (290 aa)
PIIN_10422Uncharacterized protein. (265 aa)
PIIN_10412Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_10301Uncharacterized protein. (379 aa)
PIIN_10077Related to TY3B-TY3B protein. (814 aa)
PIIN_10076Related to TY3B-TY3B protein. (513 aa)
PIIN_10064Related to TY3B-TY3B protein. (666 aa)
PIIN_10035Uncharacterized protein. (125 aa)
PIIN_09989Integrase catalytic domain-containing protein. (1127 aa)
PIIN_09940YL1_C domain-containing protein. (173 aa)
PIIN_05582Replication protein A subunit; As part of the replication protein A (RPA/RP-A), a single- stranded DNA-binding heterotrimeric complex, may play an essential role in DNA replication, recombination and repair. Binds and stabilizes single-stranded DNA intermediates, preventing complementary DNA reannealing and recruiting different proteins involved in DNA metabolism. (611 aa)
PIIN_05529WLM domain-containing protein. (380 aa)
PIIN_05491Probable UDP-galactopyranose mutase. (507 aa)
PIIN_05449Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (333 aa)
PIIN_05349Zds_C domain-containing protein. (1174 aa)
PIIN_00026Related to DNA polymerase kappa. (664 aa)
PIIN_00467Uncharacterized protein. (207 aa)
PIIN_00564DNA damage-binding protein CMR1; DNA-binding protein that binds to both single- and double- stranded DNA. Binds preferentially to UV-damaged DNA. May be involved in DNA-metabolic processes. (655 aa)
PIIN_00835Uncharacterized protein. (230 aa)
PIIN_01182Uncharacterized protein. (644 aa)
PIIN_01483CPSF_A domain-containing protein. (1145 aa)
PIIN_01488RPAP3_C domain-containing protein. (247 aa)
PIIN_01515Uncharacterized protein. (75 aa)
PIIN_01808Probable CDC31-spindle pole body component, centrin. (165 aa)
PIIN_01770Integrase catalytic domain-containing protein. (871 aa)
PIIN_02455Related to cullin 4A; Belongs to the cullin family. (658 aa)
PIIN_02460Related to ACOB protein. (293 aa)
PIIN_02592Probable COP9 signalosome complex subunit 2. (467 aa)
PIIN_03177Related to COP9 signalosome complex subunit 6. (340 aa)
PIIN_03305Poly [ADP-ribose] polymerase. (603 aa)
PIIN_03333Related to UBI4-Ubiquitin. (195 aa)
PIIN_05113Actin-related protein 8; Probably involved in transcription regulation via its interaction with the INO80 complex, a chromatin remodeling complex. Belongs to the actin family. (687 aa)
PIIN_05020CIA30 domain-containing protein. (200 aa)
PIIN_04773CBFD_NFYB_HMF domain-containing protein. (398 aa)
PIIN_04709Related to RAD2-structure-specific nuclease of the nucleotide excision repairosome. (1153 aa)
PIIN_04702Related to TY3B-TY3B protein. (2540 aa)
PIIN_04681Probable ubiquitin/ribosomal protein S27a fusion protein. (158 aa)
PIIN_04265Related to UBI4-Ubiquitin. (222 aa)
PIIN_03897Uncharacterized protein. (886 aa)
PIIN_03896Uncharacterized protein. (109 aa)
PIIN_03632Related to RAD23-nucleotide excision repair protein (Ubiquitin-like protein). (408 aa)
PIIN_09876Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (388 aa)
PIIN_09793Integrase catalytic domain-containing protein. (1315 aa)
PIIN_09621Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_09545Uncharacterized protein. (1266 aa)
PIIN_09311Integrase catalytic domain-containing protein. (728 aa)
PIIN_09278Integrase catalytic domain-containing protein. (1027 aa)
PIIN_09173Probable ring-box protein 1. (114 aa)
PIIN_08785Related to INO80-ATPase with chromatin remodeling and helicase activity. (1594 aa)
PIIN_08772PAPA-1 domain-containing protein. (430 aa)
PIIN_08760Reverse transcriptase domain-containing protein. (1142 aa)
PIIN_08759Retrotrans_gag domain-containing protein. (798 aa)
PIIN_08677PCI domain-containing protein. (428 aa)
PIIN_08112Integrase catalytic domain-containing protein. (655 aa)
PIIN_08046Integrase catalytic domain-containing protein. (1227 aa)
PIIN_07656Integrase catalytic domain-containing protein. (1557 aa)
PIIN_07498Integrase catalytic domain-containing protein. (1391 aa)
PIIN_07217Uncharacterized protein. (495 aa)
PIIN_07134Ubiquitin-like domain-containing protein. (340 aa)
PIIN_06794Related to RAD1-component of the nucleotide excision repairosome. (921 aa)
PIIN_06685Related to dna excision repair protein ercc-1. (247 aa)
PIIN_06447Uncharacterized protein. (504 aa)
PIIN_01755Uncharacterized protein. (493 aa)
PIIN_01729Uncharacterized protein. (992 aa)
PIIN_00555Uncharacterized protein. (236 aa)
PIIN_00528Probable ARP5-Actin-related protein; Belongs to the actin family. (674 aa)
PIIN_03426RuvB-like helicase; DNA helicase participates in several chromatin remodeling complexes, including the SWR1 and the INO80 complexes. (460 aa)
PIIN_11537Uncharacterized protein. (142 aa)
PIIN_11376Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (285 aa)
PIIN_11293Uncharacterized protein. (126 aa)
PIIN_11903Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (128 aa)
PIIN_11126Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (319 aa)
PIIN_10866Integrase catalytic domain-containing protein. (481 aa)
PIIN_10854Integrase catalytic domain-containing protein. (155 aa)
Your Current Organism:
Serendipita indica
NCBI taxonomy Id: 1109443
Other names: Piriformospora indica DSM 11827, S. indica DSM 11827, Serendipita indica DSM 11827
Server load: low (24%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.