STRINGSTRING
PIIN_11749 PIIN_11749 PIIN_00005 PIIN_00005 PIIN_00467 PIIN_00467 PIIN_00457 PIIN_00457 PIIN_07498 PIIN_07498 PIIN_07459 PIIN_07459 PIIN_07045 PIIN_07045 PIIN_08759 PIIN_08759 PIIN_11763 PIIN_11763 PIIN_01755 PIIN_01755 PIIN_01729 PIIN_01729 PIIN_00550 PIIN_00550 PIIN_03433 PIIN_03433 PIIN_11537 PIIN_11537 PIIN_11376 PIIN_11376 PIIN_11293 PIIN_11293 PIIN_11903 PIIN_11903 PIIN_11126 PIIN_11126 PIIN_10866 PIIN_10866 PIIN_10854 PIIN_10854 PIIN_10750 PIIN_10750 PIIN_10542 PIIN_10542 PIIN_10422 PIIN_10422 PIIN_10412 PIIN_10412 PIIN_10301 PIIN_10301 PIIN_10111 PIIN_10111 PIIN_10077 PIIN_10077 PIIN_10035 PIIN_10035 PIIN_09989 PIIN_09989 PIIN_09876 PIIN_09876 PIIN_09793 PIIN_09793 PIIN_09621 PIIN_09621 PIIN_10076 PIIN_10076 PIIN_10064 PIIN_10064 PIIN_06740 PIIN_06740 PIIN_06571 PIIN_06571 PIIN_06447 PIIN_06447 PIIN_08406 PIIN_08406 PIIN_08112 PIIN_08112 PIIN_08046 PIIN_08046 PIIN_07833 PIIN_07833 PIIN_07785 PIIN_07785 PIIN_07715 PIIN_07715 PIIN_07656 PIIN_07656 PIIN_00422 PIIN_00422 PIIN_06342 PIIN_06342 PIIN_06045 PIIN_06045 PIIN_05958 PIIN_05958 PIIN_05582 PIIN_05582 PIIN_05491 PIIN_05491 PIIN_05449 PIIN_05449 PIIN_05380 PIIN_05380 PIIN_05349 PIIN_05349 PIIN_05020 PIIN_05020 PIIN_04796 PIIN_04796 PIIN_04773 PIIN_04773 PIIN_04702 PIIN_04702 PIIN_04681 PIIN_04681 PIIN_04682 PIIN_04682 PIIN_04265 PIIN_04265 PIIN_03969 PIIN_03969 PIIN_03897 PIIN_03897 PIIN_03896 PIIN_03896 PIIN_03826 PIIN_03826 PIIN_03333 PIIN_03333 PIIN_03154 PIIN_03154 PIIN_02799 PIIN_02799 PIIN_02737 PIIN_02737 PIIN_02619 PIIN_02619 PIIN_02549 PIIN_02549 PIIN_02455 PIIN_02455 PIIN_02200 PIIN_02200 PIIN_02029 PIIN_02029 PIIN_01770 PIIN_01770 PIIN_01704 PIIN_01704 PIIN_01582 PIIN_01582 PIIN_01555 PIIN_01555 PIIN_01515 PIIN_01515 PIIN_01483 PIIN_01483 PIIN_01403 PIIN_01403 PIIN_01182 PIIN_01182 PIIN_01104 PIIN_01104 PIIN_11724 PIIN_11724 PIIN_00835 PIIN_00835 PIIN_09559 PIIN_09559 PIIN_09538 PIIN_09538 PIIN_09355 PIIN_09355 PIIN_09311 PIIN_09311 PIIN_09278 PIIN_09278 PIIN_09173 PIIN_09173 PIIN_09082 PIIN_09082 PIIN_08978 PIIN_08978 PIIN_08830 PIIN_08830 PIIN_08760 PIIN_08760
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
PIIN_11749Probable RFC5-DNA replication factor C, 40 KD subunit. (325 aa)
PIIN_00005Related to transcription elongation factor TFIIS. (280 aa)
PIIN_00467Uncharacterized protein. (207 aa)
PIIN_00457TFIIS central domain-containing protein. (833 aa)
PIIN_07498Integrase catalytic domain-containing protein. (1391 aa)
PIIN_07459Related to DNA-directed RNA polymerase 13.3K chain. (138 aa)
PIIN_07045Uncharacterized protein. (1104 aa)
PIIN_08759Retrotrans_gag domain-containing protein. (798 aa)
PIIN_11763Probable RAD3-DNA helicase/ATPase. (798 aa)
PIIN_01755Uncharacterized protein. (493 aa)
PIIN_01729Uncharacterized protein. (992 aa)
PIIN_00550Probable RFC4-DNA replication factor C, 37 kDa subunit. (334 aa)
PIIN_03433Probable ubiquitin-specific processing protease 21; Belongs to the peptidase C19 family. (1103 aa)
PIIN_11537Uncharacterized protein. (142 aa)
PIIN_11376Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (285 aa)
PIIN_11293Uncharacterized protein. (126 aa)
PIIN_11903Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (128 aa)
PIIN_11126Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (319 aa)
PIIN_10866Integrase catalytic domain-containing protein. (481 aa)
PIIN_10854Integrase catalytic domain-containing protein. (155 aa)
PIIN_10750Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (331 aa)
PIIN_10542Integrase catalytic domain-containing protein. (290 aa)
PIIN_10422Uncharacterized protein. (265 aa)
PIIN_10412Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_10301Uncharacterized protein. (379 aa)
PIIN_10111Uncharacterized protein. (165 aa)
PIIN_10077Related to TY3B-TY3B protein. (814 aa)
PIIN_10035Uncharacterized protein. (125 aa)
PIIN_09989Integrase catalytic domain-containing protein. (1127 aa)
PIIN_09876Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (388 aa)
PIIN_09793Integrase catalytic domain-containing protein. (1315 aa)
PIIN_09621Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_10076Related to TY3B-TY3B protein. (513 aa)
PIIN_10064Related to TY3B-TY3B protein. (666 aa)
PIIN_06740RRM domain-containing protein. (128 aa)
PIIN_06571Related to CYP-41 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (Cyclophilin41). (378 aa)
PIIN_06447Uncharacterized protein. (504 aa)
PIIN_08406RPOL4c domain-containing protein. (135 aa)
PIIN_08112Integrase catalytic domain-containing protein. (655 aa)
PIIN_08046Integrase catalytic domain-containing protein. (1227 aa)
PIIN_07833Probable DNA-directed RNA polymerase II 14.5 kDa polypeptide; Belongs to the archaeal rpoM/eukaryotic RPA12/RPB9/RPC11 RNA polymerase family. (131 aa)
PIIN_07785Probable CPR6-member of the cyclophilin family. (447 aa)
PIIN_07715Probable RFC2-DNA replication factor C, 41 KD subunit. (358 aa)
PIIN_07656Integrase catalytic domain-containing protein. (1557 aa)
PIIN_00422Uncharacterized protein. (756 aa)
PIIN_06342RNA polymerase II transcription factor B subunit 2; Component of the general transcription and DNA repair factor IIH (TFIIH) core complex which is involved in general and transcription-coupled nucleotide excision repair (NER) of damaged DNA. Belongs to the TFB2 family. (462 aa)
PIIN_06045Uncharacterized protein. (466 aa)
PIIN_05958Related to TFIIH basal transcription factor complex p34 subunit. (355 aa)
PIIN_05582Replication protein A subunit; As part of the replication protein A (RPA/RP-A), a single- stranded DNA-binding heterotrimeric complex, may play an essential role in DNA replication, recombination and repair. Binds and stabilizes single-stranded DNA intermediates, preventing complementary DNA reannealing and recruiting different proteins involved in DNA metabolism. (611 aa)
PIIN_05491Probable UDP-galactopyranose mutase. (507 aa)
PIIN_05449Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (333 aa)
PIIN_05380Uncharacterized protein. (319 aa)
PIIN_05349Zds_C domain-containing protein. (1174 aa)
PIIN_05020CIA30 domain-containing protein. (200 aa)
PIIN_04796Uncharacterized protein. (88 aa)
PIIN_04773CBFD_NFYB_HMF domain-containing protein. (398 aa)
PIIN_04702Related to TY3B-TY3B protein. (2540 aa)
PIIN_04681Probable ubiquitin/ribosomal protein S27a fusion protein. (158 aa)
PIIN_04682Probable RFC3-DNA replication factor C, 40 kDa subunit. (346 aa)
PIIN_04265Related to UBI4-Ubiquitin. (222 aa)
PIIN_03969Related to Cyclin H; Belongs to the cyclin family. (397 aa)
PIIN_03897Uncharacterized protein. (886 aa)
PIIN_03896Uncharacterized protein. (109 aa)
PIIN_03826General transcription and DNA repair factor IIH; Component of the general transcription and DNA repair factor IIH (TFIIH) core complex, which is involved in general and transcription-coupled nucleotide excision repair (NER) of damaged DNA and, when complexed to TFIIK, in RNA transcription by RNA polymerase II; Belongs to the GTF2H2 family. (386 aa)
PIIN_03333Related to UBI4-Ubiquitin. (195 aa)
PIIN_03154Probable SSL2-DNA helicase. (837 aa)
PIIN_02799USP domain-containing protein; Belongs to the peptidase C19 family. (1377 aa)
PIIN_02737Probable 25 kD subunit of DNA-directed RNA polymerases I, II and III. (211 aa)
PIIN_02619Probable DNA-directed RNA polymerase II chain Rpb7. (170 aa)
PIIN_02549Replication factor C subunit 1. (937 aa)
PIIN_02455Related to cullin 4A; Belongs to the cullin family. (658 aa)
PIIN_02200Related to TFB1-subunit of RNA polymerase II transcription initiation factor TFIIH. (580 aa)
PIIN_02029Related to non-snRNP spliceosome component (Pre-mRNA splicing protein PRP19). (497 aa)
PIIN_01770Integrase catalytic domain-containing protein. (871 aa)
PIIN_01704Probable KIN28-cyclin-dependent ser/thr protein kinase; Belongs to the protein kinase superfamily. (377 aa)
PIIN_01582CYCLIN domain-containing protein; Belongs to the cyclin family. (380 aa)
PIIN_01555DNA-directed RNA polymerase subunit; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. (1796 aa)
PIIN_01515Uncharacterized protein. (75 aa)
PIIN_01483CPSF_A domain-containing protein. (1145 aa)
PIIN_01403Related to RPB3-DNA-directed RNA polymerase II chain. (336 aa)
PIIN_01182Uncharacterized protein. (644 aa)
PIIN_01104Uncharacterized protein. (72 aa)
PIIN_11724MAT1 domain-containing protein. (165 aa)
PIIN_00835Uncharacterized protein. (230 aa)
PIIN_09559Uncharacterized protein. (136 aa)
PIIN_09538Probable Rpo26-18kD subunit of DNA-directed RNA polymerases I, II, III. (164 aa)
PIIN_09355DNA-directed RNA polymerase subunit beta; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. (1223 aa)
PIIN_09311Integrase catalytic domain-containing protein. (728 aa)
PIIN_09278Integrase catalytic domain-containing protein. (1027 aa)
PIIN_09173Probable ring-box protein 1. (114 aa)
PIIN_09082Related to SYF1-synthetic lethal with CDC40. (970 aa)
PIIN_08978Related to pre-mRNA splicing factor. (311 aa)
PIIN_08830Related to RFA2-DNA replication factor A, 36 kDa subunit. (292 aa)
PIIN_08760Reverse transcriptase domain-containing protein. (1142 aa)
Your Current Organism:
Serendipita indica
NCBI taxonomy Id: 1109443
Other names: Piriformospora indica DSM 11827, S. indica DSM 11827, Serendipita indica DSM 11827
Server load: low (30%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.