STRINGSTRING
PIIN_01770 PIIN_01770 PIIN_11770 PIIN_11770 PIIN_02200 PIIN_02200 PIIN_02218 PIIN_02218 PIIN_02455 PIIN_02455 PIIN_02549 PIIN_02549 PIIN_03154 PIIN_03154 PIIN_03514 PIIN_03514 PIIN_03632 PIIN_03632 PIIN_03826 PIIN_03826 PIIN_03896 PIIN_03896 PIIN_03897 PIIN_03897 PIIN_03966 PIIN_03966 PIIN_03969 PIIN_03969 PIIN_04103 PIIN_04103 PIIN_04489 PIIN_04489 PIIN_04580 PIIN_04580 PIIN_04682 PIIN_04682 PIIN_04702 PIIN_04702 PIIN_04709 PIIN_04709 PIIN_04755 PIIN_04755 PIIN_04773 PIIN_04773 PIIN_05114 PIIN_05114 PIIN_05250 PIIN_05250 PIIN_05349 PIIN_05349 PIIN_05420 PIIN_05420 PIIN_05449 PIIN_05449 PIIN_05491 PIIN_05491 PIIN_05582 PIIN_05582 PIIN_05647 PIIN_05647 PIIN_05828 PIIN_05828 PIIN_05958 PIIN_05958 PIIN_06342 PIIN_06342 PIIN_06407 PIIN_06407 PIIN_06447 PIIN_06447 PIIN_06685 PIIN_06685 PIIN_06794 PIIN_06794 PIIN_07134 PIIN_07134 PIIN_07305 PIIN_07305 PIIN_07498 PIIN_07498 PIIN_07656 PIIN_07656 PIIN_07715 PIIN_07715 PIIN_08046 PIIN_08046 PIIN_08112 PIIN_08112 PIIN_08759 PIIN_08759 PIIN_08760 PIIN_08760 PIIN_08830 PIIN_08830 PIIN_09173 PIIN_09173 PIIN_09278 PIIN_09278 PIIN_09311 PIIN_09311 PIIN_09559 PIIN_09559 PIIN_09621 PIIN_09621 PIIN_09746 PIIN_09746 PIIN_09793 PIIN_09793 PIIN_09876 PIIN_09876 PIIN_09989 PIIN_09989 PIIN_10035 PIIN_10035 PIIN_10064 PIIN_10064 PIIN_10076 PIIN_10076 PIIN_10077 PIIN_10077 PIIN_10301 PIIN_10301 PIIN_10412 PIIN_10412 PIIN_10422 PIIN_10422 PIIN_10542 PIIN_10542 PIIN_10854 PIIN_10854 PIIN_10866 PIIN_10866 PIIN_11126 PIIN_11126 PIIN_11903 PIIN_11903 PIIN_11293 PIIN_11293 PIIN_11376 PIIN_11376 PIIN_11537 PIIN_11537 PIIN_02963 PIIN_02963 PIIN_02985 PIIN_02985 PIIN_00550 PIIN_00550 PIIN_01729 PIIN_01729 PIIN_01755 PIIN_01755 PIIN_11763 PIIN_11763 PIIN_10750 PIIN_10750 PIIN_00149 PIIN_00149 PIIN_11749 PIIN_11749 PIIN_00467 PIIN_00467 PIIN_00564 PIIN_00564 PIIN_00835 PIIN_00835 PIIN_11724 PIIN_11724 PIIN_01107 PIIN_01107 PIIN_01182 PIIN_01182 PIIN_01285 PIIN_01285 PIIN_01483 PIIN_01483 PIIN_01495 PIIN_01495 PIIN_01503 PIIN_01503 PIIN_01515 PIIN_01515 PIIN_01582 PIIN_01582 PIIN_01704 PIIN_01704
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
PIIN_01770Integrase catalytic domain-containing protein. (871 aa)
PIIN_11770Uncharacterized protein. (749 aa)
PIIN_02200Related to TFB1-subunit of RNA polymerase II transcription initiation factor TFIIH. (580 aa)
PIIN_02218DNA polymerase epsilon catalytic subunit; DNA polymerase II participates in chromosomal DNA replication; Belongs to the DNA polymerase type-B family. (2263 aa)
PIIN_02455Related to cullin 4A; Belongs to the cullin family. (658 aa)
PIIN_02549Replication factor C subunit 1. (937 aa)
PIIN_03154Probable SSL2-DNA helicase. (837 aa)
PIIN_03514DNA polymerase. (1069 aa)
PIIN_03632Related to RAD23-nucleotide excision repair protein (Ubiquitin-like protein). (408 aa)
PIIN_03826General transcription and DNA repair factor IIH; Component of the general transcription and DNA repair factor IIH (TFIIH) core complex, which is involved in general and transcription-coupled nucleotide excision repair (NER) of damaged DNA and, when complexed to TFIIK, in RNA transcription by RNA polymerase II; Belongs to the GTF2H2 family. (386 aa)
PIIN_03896Uncharacterized protein. (109 aa)
PIIN_03897Uncharacterized protein. (886 aa)
PIIN_03966Related to DNA ligase (ATP). (1020 aa)
PIIN_03969Related to Cyclin H; Belongs to the cyclin family. (397 aa)
PIIN_04103Related to probable RNA helicase MPH1. (1197 aa)
PIIN_04489Uncharacterized protein. (214 aa)
PIIN_04580annotation not available (683 aa)
PIIN_04682Probable RFC3-DNA replication factor C, 40 kDa subunit. (346 aa)
PIIN_04702Related to TY3B-TY3B protein. (2540 aa)
PIIN_04709Related to RAD2-structure-specific nuclease of the nucleotide excision repairosome. (1153 aa)
PIIN_04755Uncharacterized protein. (339 aa)
PIIN_04773CBFD_NFYB_HMF domain-containing protein. (398 aa)
PIIN_05114Related to YJU2-Essential nuclear protein, putative spliceosomal component. (281 aa)
PIIN_05250Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (194 aa)
PIIN_05349Zds_C domain-containing protein. (1174 aa)
PIIN_05420Related to DNA ligase. (437 aa)
PIIN_05449Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (333 aa)
PIIN_05491Probable UDP-galactopyranose mutase. (507 aa)
PIIN_05582Replication protein A subunit; As part of the replication protein A (RPA/RP-A), a single- stranded DNA-binding heterotrimeric complex, may play an essential role in DNA replication, recombination and repair. Binds and stabilizes single-stranded DNA intermediates, preventing complementary DNA reannealing and recruiting different proteins involved in DNA metabolism. (611 aa)
PIIN_05647Uncharacterized protein. (781 aa)
PIIN_05828Related to DNA repair protein RAD14. (354 aa)
PIIN_05958Related to TFIIH basal transcription factor complex p34 subunit. (355 aa)
PIIN_06342RNA polymerase II transcription factor B subunit 2; Component of the general transcription and DNA repair factor IIH (TFIIH) core complex which is involved in general and transcription-coupled nucleotide excision repair (NER) of damaged DNA. Belongs to the TFB2 family. (462 aa)
PIIN_06407DNA ligase. (826 aa)
PIIN_06447Uncharacterized protein. (504 aa)
PIIN_06685Related to dna excision repair protein ercc-1. (247 aa)
PIIN_06794Related to RAD1-component of the nucleotide excision repairosome. (921 aa)
PIIN_07134Ubiquitin-like domain-containing protein. (340 aa)
PIIN_07305Related to ATP-dependent DNA helicase. (959 aa)
PIIN_07498Integrase catalytic domain-containing protein. (1391 aa)
PIIN_07656Integrase catalytic domain-containing protein. (1557 aa)
PIIN_07715Probable RFC2-DNA replication factor C, 41 KD subunit. (358 aa)
PIIN_08046Integrase catalytic domain-containing protein. (1227 aa)
PIIN_08112Integrase catalytic domain-containing protein. (655 aa)
PIIN_08759Retrotrans_gag domain-containing protein. (798 aa)
PIIN_08760Reverse transcriptase domain-containing protein. (1142 aa)
PIIN_08830Related to RFA2-DNA replication factor A, 36 kDa subunit. (292 aa)
PIIN_09173Probable ring-box protein 1. (114 aa)
PIIN_09278Integrase catalytic domain-containing protein. (1027 aa)
PIIN_09311Integrase catalytic domain-containing protein. (728 aa)
PIIN_09559Uncharacterized protein. (136 aa)
PIIN_09621Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_09746Uncharacterized protein. (736 aa)
PIIN_09793Integrase catalytic domain-containing protein. (1315 aa)
PIIN_09876Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (388 aa)
PIIN_09989Integrase catalytic domain-containing protein. (1127 aa)
PIIN_10035Uncharacterized protein. (125 aa)
PIIN_10064Related to TY3B-TY3B protein. (666 aa)
PIIN_10076Related to TY3B-TY3B protein. (513 aa)
PIIN_10077Related to TY3B-TY3B protein. (814 aa)
PIIN_10301Uncharacterized protein. (379 aa)
PIIN_10412Integrase catalytic domain-containing protein. (804 aa)
PIIN_10422Uncharacterized protein. (265 aa)
PIIN_10542Integrase catalytic domain-containing protein. (290 aa)
PIIN_10854Integrase catalytic domain-containing protein. (155 aa)
PIIN_10866Integrase catalytic domain-containing protein. (481 aa)
PIIN_11126Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (319 aa)
PIIN_11903Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (128 aa)
PIIN_11293Uncharacterized protein. (126 aa)
PIIN_11376Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (285 aa)
PIIN_11537Uncharacterized protein. (142 aa)
PIIN_02963CBFD_NFYB_HMF domain-containing protein. (228 aa)
PIIN_02985Uncharacterized protein. (399 aa)
PIIN_00550Probable RFC4-DNA replication factor C, 37 kDa subunit. (334 aa)
PIIN_01729Uncharacterized protein. (992 aa)
PIIN_01755Uncharacterized protein. (493 aa)
PIIN_11763Probable RAD3-DNA helicase/ATPase. (798 aa)
PIIN_10750Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein. (331 aa)
PIIN_00149DNA polymerase epsilon subunit; Participates in DNA repair and in chromosomal DNA replication; Belongs to the DNA polymerase epsilon subunit B family. (542 aa)
PIIN_11749Probable RFC5-DNA replication factor C, 40 KD subunit. (325 aa)
PIIN_00467Uncharacterized protein. (207 aa)
PIIN_00564DNA damage-binding protein CMR1; DNA-binding protein that binds to both single- and double- stranded DNA. Binds preferentially to UV-damaged DNA. May be involved in DNA-metabolic processes. (655 aa)
PIIN_00835Uncharacterized protein. (230 aa)
PIIN_11724MAT1 domain-containing protein. (165 aa)
PIIN_01107Related to dna polymerase delta small subunit. (480 aa)
PIIN_01182Uncharacterized protein. (644 aa)
PIIN_01285Proliferating cell nuclear antigen; This protein is an auxiliary protein of DNA polymerase delta and is involved in the control of eukaryotic DNA replication by increasing the polymerase's processibility during elongation of the leading strand; Belongs to the PCNA family. (330 aa)
PIIN_01483CPSF_A domain-containing protein. (1145 aa)
PIIN_01495Related to CHL1-protein of the DEAH box family. (769 aa)
PIIN_01503CBFD_NFYB_HMF domain-containing protein. (192 aa)
PIIN_01515Uncharacterized protein. (75 aa)
PIIN_01582CYCLIN domain-containing protein; Belongs to the cyclin family. (380 aa)
PIIN_01704Probable KIN28-cyclin-dependent ser/thr protein kinase; Belongs to the protein kinase superfamily. (377 aa)
Your Current Organism:
Serendipita indica
NCBI taxonomy Id: 1109443
Other names: Piriformospora indica DSM 11827, S. indica DSM 11827, Serendipita indica DSM 11827
Server load: low (32%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.