STRINGSTRING
Csa_7G206940 Csa_7G206940 Csa_7G062800 Csa_7G062800 Csa_7G074280 Csa_7G074280 Csa_7G390140 Csa_7G390140 Csa_7G375800 Csa_7G375800 Csa_7G431360 Csa_7G431360 Csa_7G388420 Csa_7G388420 Csa_7G237870 Csa_7G237870 Csa_6G014750 Csa_6G014750 Csa_7G412850 Csa_7G412850 Csa_7G336560 Csa_7G336560 Csa_6G045040 Csa_6G045040 LSM3 LSM3 Csa_7G447710 Csa_7G447710 Csa_6G089220 Csa_6G089220 LSM4 LSM4 Csa_7G428250 Csa_7G428250 Csa_7G432440 Csa_7G432440 Csa_7G431430 Csa_7G431430 Csa_6G118290 Csa_6G118290 Csa_6G319790 Csa_6G319790 Csa_6G014760 Csa_6G014760 Csa_6G104100 Csa_6G104100 Csa_6G311530 Csa_6G311530 Csa_6G382870 Csa_6G382870 Csa_6G366550 Csa_6G366550 Csa_6G502610 Csa_6G502610 Csa_6G404170 Csa_6G404170 Csa_6G514910 Csa_6G514910 Csa_6G452700 Csa_6G452700 Csa_6G430680 Csa_6G430680 Csa_6G495630 Csa_6G495630 Csa_6G450960 Csa_6G450960 Csa_6G405880 Csa_6G405880 Csa_6G511850 Csa_6G511850 Csa_6G520320 Csa_6G520320 Csa_5G003615 Csa_5G003615 Csa_6G517050 Csa_6G517050 Csa_5G175720 Csa_5G175720 Csa_5G177130 Csa_5G177130 Csa_6G504425 Csa_6G504425 Csa_6G526300 Csa_6G526300 Csa_5G033980 Csa_5G033980 Csa_5G175900 Csa_5G175900 Csa_5G179230 Csa_5G179230 Csa_5G601580 Csa_5G601580 Csa_5G623590 Csa_5G623590 Csa_5G602130 Csa_5G602130 Csa_5G603360 Csa_5G603360 Csa_5G523170 Csa_5G523170 Csa_5G215110 Csa_5G215110 Csa_5G266840 Csa_5G266840 Csa_5G346540 Csa_5G346540 Csa_5G588760 Csa_5G588760 Csa_5G429980 Csa_5G429980 Csa_5G624450 Csa_5G624450 Csa_4G025080 Csa_4G025080 Csa_4G046730 Csa_4G046730 Csa_4G110070 Csa_4G110070 Csa_4G001840 Csa_4G001840 Csa_5G648670 Csa_5G648670 Csa_5G650610 Csa_5G650610 Csa_4G308540 Csa_4G308540 Csa_4G623900 Csa_4G623900 Csa_4G578870 Csa_4G578870 Csa_4G290770 Csa_4G290770 Csa_3G125010 Csa_3G125010 Csa_3G088960 Csa_3G088960 Csa_4G646250 Csa_4G646250 Csa_4G658560 Csa_4G658560 Csa_3G171110 Csa_3G171110 Csa_3G055970 Csa_3G055970 Csa_3G134680 Csa_3G134680 Csa_3G134970 Csa_3G134970 Csa_3G257080 Csa_3G257080 Csa_3G077650 Csa_3G077650 Csa_3G168950 Csa_3G168950 Csa_3G611350 Csa_3G611350 LSM5 LSM5 Csa_3G135040 Csa_3G135040 Csa_3G172960 Csa_3G172960 Csa_3G636410 Csa_3G636410 Csa_3G851900 Csa_3G851900 Csa_3G697950 Csa_3G697950 Csa_3G426330 Csa_3G426330 Csa_3G603040 Csa_3G603040 Csa_3G743440 Csa_3G743440 Csa_3G792040 Csa_3G792040 Csa_2G020930 Csa_2G020930 Csa_2G033300 Csa_2G033300 Csa_2G036090 Csa_2G036090 Csa_3G777000 Csa_3G777000 Csa_3G777640 Csa_3G777640 Csa_3G790440 Csa_3G790440 Csa_2G100010 Csa_2G100010 Csa_2G009370 Csa_2G009370 Csa_2G00990 Csa_2G00990 Csa_2G033290 Csa_2G033290 Csa_2G270830 Csa_2G270830 Csa_2G061560 Csa_2G061560 Csa_2G287060 Csa_2G287060 Csa_2G033890 Csa_2G033890 Csa_2G404860 Csa_2G404860 Csa_2G075450 Csa_2G075450 Csa_1G025950 Csa_1G025950 Csa_1G025140 Csa_1G025140 Csa_2G379180 Csa_2G379180 Csa_1G042680 Csa_1G042680 Csa_1G045630 Csa_1G045630 Csa_1G043260 Csa_1G043260 Csa_1G000560 Csa_1G000560 Csa_1G144280 Csa_1G144280 Csa_1G153010 Csa_1G153010 Csa_2G395940 Csa_2G395940 Csa_1G153530 Csa_1G153530 LSM8 LSM8 Csa_1G185102 Csa_1G185102 Csa_1G039130 Csa_1G039130 Csa_2G428990 Csa_2G428990 Csa_1G423230 Csa_1G423230 Csa_1G418790 Csa_1G418790 Csa_1G470260 Csa_1G470260 Csa_1G012660 Csa_1G012660 Csa_1G532280 Csa_1G532280 Csa_1G039950 Csa_1G039950 Csa_1G050450 Csa_1G050450 Csa_1G051780 Csa_1G051780 Csa_1G682130 Csa_1G682130 Csa_1G682630 Csa_1G682630
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
Csa_7G206940Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_7G062800OCRE domain-containing protein. (409 aa)
Csa_7G074280Matrin-type domain-containing protein. (254 aa)
Csa_7G390140U1 small nuclear ribonucleoprotein C; Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates commitment or early (E) complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region. (197 aa)
Csa_7G375800Uncharacterized protein. (1298 aa)
Csa_7G431360Uncharacterized protein. (1502 aa)
Csa_7G388420SFM domain-containing protein. (420 aa)
Csa_7G237870Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides. (601 aa)
Csa_6G014750Helicase ATP-binding domain-containing protein. (105 aa)
Csa_7G412850Uncharacterized protein. (732 aa)
Csa_7G336560Uncharacterized protein. (81 aa)
Csa_6G045040Uncharacterized protein. (671 aa)
LSM3U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (97 aa)
Csa_7G447710Uncharacterized protein. (845 aa)
Csa_6G089220LRRcap domain-containing protein. (220 aa)
LSM4U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (149 aa)
Csa_7G428250Sm-like protein LSM2; Component of LSM protein complexes, which are involved in RNA processing. (93 aa)
Csa_7G432440MPN domain-containing protein. (2347 aa)
Csa_7G431430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_6G118290RRM domain-containing protein. (357 aa)
Csa_6G319790WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (476 aa)
Csa_6G014760Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_6G104100Uncharacterized protein. (1023 aa)
Csa_6G311530Uncharacterized protein. (936 aa)
Csa_6G382870Uncharacterized protein. (322 aa)
Csa_6G366550RRM domain-containing protein. (171 aa)
Csa_6G502610RRM domain-containing protein. (505 aa)
Csa_6G404170WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (569 aa)
Csa_6G514910Uncharacterized protein. (96 aa)
Csa_6G452700Small nuclear ribonucleoprotein G. (80 aa)
Csa_6G430680RRM domain-containing protein. (125 aa)
Csa_6G495630Uncharacterized protein. (592 aa)
Csa_6G450960Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_6G405880Ubiquitin-like protein. (73 aa)
Csa_6G511850Uncharacterized protein. (439 aa)
Csa_6G520320Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_5G003615Uncharacterized protein. (465 aa)
Csa_6G517050TPR_REGION domain-containing protein. (913 aa)
Csa_5G175720Uncharacterized protein. (102 aa)
Csa_5G177130Uncharacterized protein. (923 aa)
Csa_6G504425Uncharacterized protein. (74 aa)
Csa_6G526300Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein. (284 aa)
Csa_5G033980Uncharacterized protein. (244 aa)
Csa_5G175900PWWP domain-containing protein. (2067 aa)
Csa_5G179230CPSF_A domain-containing protein. (1214 aa)
Csa_5G601580WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (581 aa)
Csa_5G623590Uncharacterized protein. (1568 aa)
Csa_5G602130Nop domain-containing protein. (484 aa)
Csa_5G603360Uncharacterized protein. (825 aa)
Csa_5G523170Uncharacterized protein. (1119 aa)
Csa_5G215110Uncharacterized protein. (687 aa)
Csa_5G266840Sm domain-containing protein. (92 aa)
Csa_5G346540Uncharacterized protein. (157 aa)
Csa_5G588760WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (344 aa)
Csa_5G429980DUF1716 domain-containing protein. (526 aa)
Csa_5G624450Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (191 aa)
Csa_4G025080Cir_N domain-containing protein. (417 aa)
Csa_4G046730Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2. (188 aa)
Csa_4G110070TOG domain-containing protein. (1262 aa)
Csa_4G001840Uncharacterized protein. (242 aa)
Csa_5G648670Uncharacterized protein. (485 aa)
Csa_5G650610Uncharacterized protein. (939 aa)
Csa_4G308540Uncharacterized protein. (395 aa)
Csa_4G623900Sm domain-containing protein. (61 aa)
Csa_4G578870MFAP1 domain-containing protein. (433 aa)
Csa_4G290770MI domain-containing protein. (797 aa)
Csa_3G125010Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (194 aa)
Csa_3G088960WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (277 aa)
Csa_4G646250PPIase cyclophilin-type domain-containing protein. (494 aa)
Csa_4G658560Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3; Core component of the spliceosomal U1, U2, U4 and U5 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), the building blocks of the spliceosome. (132 aa)
Csa_3G171110Uncharacterized protein. (103 aa)
Csa_3G055970Uncharacterized protein. (228 aa)
Csa_3G134680Uncharacterized protein. (522 aa)
Csa_3G134970Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_3G257080Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (715 aa)
Csa_3G077650Uncharacterized protein. (712 aa)
Csa_3G168950Uncharacterized protein. (2175 aa)
Csa_3G611350WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (646 aa)
LSM5U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5; Plays a role in U6 snRNP assembly and function. Binds to the 3' end of U6 snRNA. (87 aa)
Csa_3G135040Slu7 domain-containing protein. (540 aa)
Csa_3G172960Uncharacterized protein. (379 aa)
Csa_3G636410G-patch domain-containing protein. (500 aa)
Csa_3G851900Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1; Involved in splicing regulation. Facilitates post- transcriptional gene silencing (PTGS) by limiting the degradation of transgene aberrant RNAs by the RNA quality control (RQC) machinery, thus favoring their entry into cytoplasmic siRNA bodies where they can trigger PTGS. Does not participate in the production of small RNAs. Belongs to the snRNP core protein family. (114 aa)
Csa_3G697950Sm domain-containing protein. (99 aa)
Csa_3G426330FHA domain-containing protein. (353 aa)
Csa_3G603040Matrin-type domain-containing protein. (508 aa)
Csa_3G743440Matrin-type domain-containing protein. (341 aa)
Csa_3G792040CPSF_A domain-containing protein. (1376 aa)
Csa_2G020930Slu7 domain-containing protein. (536 aa)
Csa_2G033300Uncharacterized protein. (255 aa)
Csa_2G036090Uncharacterized protein. (517 aa)
Csa_3G777000Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_3G777640Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (164 aa)
Csa_3G790440Uncharacterized protein. (561 aa)
Csa_2G100010PPIase cyclophilin-type domain-containing protein. (125 aa)
Csa_2G009370Tr-type G domain-containing protein. (1090 aa)
Csa_2G00990SKIP_SNW domain-containing protein. (605 aa)
Csa_2G033290Uncharacterized protein. (164 aa)
Csa_2G270830Uncharacterized protein. (315 aa)
Csa_2G061560SKIP_SNW domain-containing protein. (603 aa)
Csa_2G287060Uncharacterized protein. (142 aa)
Csa_2G033890U1-type domain-containing protein. (202 aa)
Csa_2G404860Uncharacterized protein. (809 aa)
Csa_2G075450PSP domain-containing protein. (580 aa)
Csa_1G025950Uncharacterized protein. (231 aa)
Csa_1G025140Uncharacterized protein. (1118 aa)
Csa_2G379180Cwf21 domain-containing protein. (906 aa)
Csa_1G042680Uncharacterized protein. (256 aa)
Csa_1G045630Uncharacterized protein. (535 aa)
Csa_1G043260Uncharacterized protein. (194 aa)
Csa_1G000560WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (520 aa)
Csa_1G144280Uncharacterized protein. (532 aa)
Csa_1G153010Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_2G395940Uncharacterized protein. (135 aa)
Csa_1G153530Uncharacterized protein. (624 aa)
LSM8U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8; Plays role in pre-mRNA splicing as component of the U4/U6-U5 tri-snRNP complex that is involved in spliceosome assembly, and as component of the precatalytic spliceosome (spliceosome B complex). The heptameric LSM2-8 complex binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (98 aa)
Csa_1G185102Uncharacterized protein. (550 aa)
Csa_1G039130Helicase C-terminal domain-containing protein. (497 aa)
Csa_2G428990Uncharacterized protein. (556 aa)
Csa_1G423230SNRNP27 domain-containing protein. (232 aa)
Csa_1G418790Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_1G470260Uncharacterized protein. (373 aa)
Csa_1G012660Uncharacterized protein. (1055 aa)
Csa_1G532280Uncharacterized protein. (110 aa)
Csa_1G039950Uncharacterized protein. (350 aa)
Csa_1G050450Uncharacterized protein. (232 aa)
Csa_1G051780WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (524 aa)
Csa_1G682130Uncharacterized protein. (394 aa)
Csa_1G682630Uncharacterized protein. (516 aa)
Your Current Organism:
Cucumis sativus
NCBI taxonomy Id: 3659
Other names: C. sativus, Cucumis sativus L., cucumber, cucumbers
Server load: low (14%) [HD]