STRINGSTRING
Csa_1G266150 Csa_1G266150 Csa_7G206940 Csa_7G206940 Csa_7G074280 Csa_7G074280 Csa_7G390140 Csa_7G390140 Csa_7G397040 Csa_7G397040 Csa_7G375800 Csa_7G375800 Csa_7G239560 Csa_7G239560 Csa_7G432260 Csa_7G432260 Csa_7G431360 Csa_7G431360 Csa_7G062820 Csa_7G062820 Csa_7G388420 Csa_7G388420 Csa_7G336560 Csa_7G336560 Csa_6G045040 Csa_6G045040 Csa_6G055950 Csa_6G055950 LSM3 LSM3 Csa_6G089220 Csa_6G089220 LSM4 LSM4 Csa_7G428250 Csa_7G428250 Csa_6G004500 Csa_6G004500 Csa_7G432440 Csa_7G432440 Csa_6G056470 Csa_6G056470 Csa_6G149930 Csa_6G149930 Csa_7G431430 Csa_7G431430 Csa_6G055965 Csa_6G055965 Csa_6G118290 Csa_6G118290 Csa_6G319790 Csa_6G319790 Csa_6G104100 Csa_6G104100 Csa_6G055960 Csa_6G055960 Csa_6G088040 Csa_6G088040 Csa_6G449300 Csa_6G449300 Csa_6G450380 Csa_6G450380 Csa_6G486680 Csa_6G486680 Csa_6G502610 Csa_6G502610 Csa_6G404170 Csa_6G404170 Csa_6G452700 Csa_6G452700 Csa_6G509620 Csa_6G509620 Csa_6G430680 Csa_6G430680 Csa_6G521100 Csa_6G521100 Csa_6G450960 Csa_6G450960 Csa_6G405880 Csa_6G405880 Csa_5G128230 Csa_5G128230 Csa_6G511850 Csa_6G511850 Csa_6G423430 Csa_6G423430 Csa_6G520320 Csa_6G520320 Csa_5G162020 Csa_5G162020 Csa_6G526430 Csa_6G526430 Csa_5G003615 Csa_5G003615 Csa_6G517050 Csa_6G517050 Csa_5G175720 Csa_5G175720 Csa_5G126730 Csa_5G126730 Csa_5G129300 Csa_5G129300 Csa_5G177130 Csa_5G177130 Csa_5G138510 Csa_5G138510 Csa_6G504425 Csa_6G504425 Csa_5G033990 Csa_5G033990 Csa_5G181460 Csa_5G181460 Csa_6G525420 Csa_6G525420 Csa_6G526300 Csa_6G526300 Csa_5G033980 Csa_5G033980 Csa_5G171150 Csa_5G171150 Csa_5G175900 Csa_5G175900 Csa_5G593360 Csa_5G593360 Csa_5G177120 Csa_5G177120 Csa_5G179230 Csa_5G179230 Csa_5G601580 Csa_5G601580 Csa_5G608560 Csa_5G608560 Csa_5G319920 Csa_5G319920 Csa_5G623590 Csa_5G623590 Csa_5G172900 Csa_5G172900 Csa_5G173440 Csa_5G173440 Csa_5G177110 Csa_5G177110 Csa_5G602130 Csa_5G602130 Csa_5G647360 Csa_5G647360 Csa_5G266840 Csa_5G266840 Csa_4G000610 Csa_4G000610 Csa_5G598010 Csa_5G598010 Csa_4G006470 Csa_4G006470 Csa_5G602160 Csa_5G602160 Csa_4G025080 Csa_4G025080 Csa_5G608300 Csa_5G608300 Csa_4G046730 Csa_4G046730 Csa_4G050790 Csa_4G050790 Csa_4G102290 Csa_4G102290 Csa_4G110070 Csa_4G110070 Csa_4G129020 Csa_4G129020 Csa_5G608340 Csa_5G608340 Csa_4G016410 Csa_4G016410 Csa_5G650610 Csa_5G650610 Csa_4G192160 Csa_4G192160 Csa_4G491190 Csa_4G491190 Csa_4G607050 Csa_4G607050 Csa_4G308540 Csa_4G308540 Csa_4G623900 Csa_4G623900 Csa_4G644700 Csa_4G644700 Csa_4G578870 Csa_4G578870 Csa_3G063650 Csa_3G063650 Csa_4G488690 Csa_4G488690 LSM4-2 LSM4-2 Csa_4G652840 Csa_4G652840 Csa_4G664540 Csa_4G664540 Csa_3G088960 Csa_3G088960 Csa_3G111250 Csa_3G111250 Csa_3G149880 Csa_3G149880 Csa_4G658560 Csa_4G658560 Csa_3G171110 Csa_3G171110 Csa_3G055970 Csa_3G055970 Csa_3G134680 Csa_3G134680 Csa_3G134970 Csa_3G134970 Csa_3G257080 Csa_3G257080 Csa_3G063660 Csa_3G063660 Csa_3G168950 Csa_3G168950 Csa_3G119350 Csa_3G119350 Csa_3G636980 Csa_3G636980 LSM5 LSM5 Csa_3G135040 Csa_3G135040 Csa_3G748150 Csa_3G748150 Csa_3G625100 Csa_3G625100 Csa_3G636410 Csa_3G636410 Csa_3G851900 Csa_3G851900 Csa_3G603040 Csa_3G603040 Csa_3G743440 Csa_3G743440 Csa_3G792040 Csa_3G792040 Csa_3G881900 Csa_3G881900 Csa_2G006160 Csa_2G006160 Csa_3G822240 Csa_3G822240 Csa_2G020930 Csa_2G020930 Csa_2G013240 Csa_2G013240 Csa_3G790440 Csa_3G790440 Csa_3G792060 Csa_3G792060 Csa_2G075290 Csa_2G075290 Csa_3G877630 Csa_3G877630 Csa_2G062630 Csa_2G062630 Csa_2G009370 Csa_2G009370 Csa_2G00990 Csa_2G00990 Csa_2G270830 Csa_2G270830 Csa_2G349690 Csa_2G349690 Csa_2G061560 Csa_2G061560 Csa_2G099460 Csa_2G099460 Csa_2G247040 Csa_2G247040 Csa_2G287060 Csa_2G287060 Csa_2G033890 Csa_2G033890 Csa_2G404860 Csa_2G404860 Csa_2G075450 Csa_2G075450 Csa_2G431100 Csa_2G431100 Csa_1G004190 Csa_1G004190 Csa_1G025140 Csa_1G025140 Csa_2G345920 Csa_2G345920 Csa_2G382800 Csa_2G382800 Csa_2G349650 Csa_2G349650 Csa_1G045630 Csa_1G045630 Csa_2G435470 Csa_2G435470 Csa_1G144280 Csa_1G144280 Csa_1G153010 Csa_1G153010 Csa_1G126050 Csa_1G126050 Csa_2G395940 Csa_2G395940 LSM8 LSM8 Csa_1G231020 Csa_1G231020 Csa_1G045770 Csa_1G045770 Csa_1G185102 Csa_1G185102 Csa_2G428990 Csa_2G428990 Csa_1G269330 Csa_1G269330 Csa_1G320360 Csa_1G320360 Csa_1G418250 Csa_1G418250 Csa_1G418790 Csa_1G418790 Csa_1G460000 Csa_1G460000 Csa_1G532280 Csa_1G532280 Csa_1G145960 Csa_1G145960 Csa_1G538260 Csa_1G538260 Csa_1G637960 Csa_1G637960 Csa_1G538270 Csa_1G538270 Csa_1G682130 Csa_1G682130 Csa_1G630290 Csa_1G630290 Csa_1G427510 Csa_1G427510 Csa_1G616300 Csa_1G616300 Csa_1G633380 Csa_1G633380 Csa_1G682630 Csa_1G682630 Csa_1G569330 Csa_1G569330 Csa_1G588540 Csa_1G588540
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
Csa_1G266150Uncharacterized protein. (783 aa)
Csa_7G206940Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_7G074280Matrin-type domain-containing protein. (254 aa)
Csa_7G390140U1 small nuclear ribonucleoprotein C; Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates commitment or early (E) complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region. (197 aa)
Csa_7G397040Uncharacterized protein. (274 aa)
Csa_7G375800Uncharacterized protein. (1298 aa)
Csa_7G239560Uncharacterized protein. (143 aa)
Csa_7G432260Uncharacterized protein. (717 aa)
Csa_7G431360Uncharacterized protein. (1502 aa)
Csa_7G062820RRM domain-containing protein. (283 aa)
Csa_7G388420SFM domain-containing protein. (420 aa)
Csa_7G336560Uncharacterized protein. (81 aa)
Csa_6G045040Uncharacterized protein. (671 aa)
Csa_6G055950Uncharacterized protein. (80 aa)
LSM3U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (97 aa)
Csa_6G089220LRRcap domain-containing protein. (220 aa)
LSM4U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (149 aa)
Csa_7G428250Sm-like protein LSM2; Component of LSM protein complexes, which are involved in RNA processing. (93 aa)
Csa_6G004500Uncharacterized protein. (142 aa)
Csa_7G432440MPN domain-containing protein. (2347 aa)
Csa_6G056470Uncharacterized protein. (260 aa)
Csa_6G149930Protein kinase domain-containing protein. (544 aa)
Csa_7G431430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_6G055965Uncharacterized protein. (214 aa)
Csa_6G118290RRM domain-containing protein. (357 aa)
Csa_6G319790WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (476 aa)
Csa_6G104100Uncharacterized protein. (1023 aa)
Csa_6G055960Uncharacterized protein. (258 aa)
Csa_6G088040Uncharacterized protein. (831 aa)
Csa_6G449300Protein kinase domain-containing protein. (546 aa)
Csa_6G450380Uncharacterized protein. (317 aa)
Csa_6G486680WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (299 aa)
Csa_6G502610RRM domain-containing protein. (505 aa)
Csa_6G404170WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (569 aa)
Csa_6G452700Small nuclear ribonucleoprotein G. (80 aa)
Csa_6G509620Protein kinase domain-containing protein. (444 aa)
Csa_6G430680RRM domain-containing protein. (125 aa)
Csa_6G521100Uncharacterized protein. (831 aa)
Csa_6G450960Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_6G405880Ubiquitin-like protein. (73 aa)
Csa_5G128230Uncharacterized protein. (126 aa)
Csa_6G511850Uncharacterized protein. (439 aa)
Csa_6G423430AML1. (846 aa)
Csa_6G520320Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_5G162020Uncharacterized protein. (420 aa)
Csa_6G526430RRM domain-containing protein. (158 aa)
Csa_5G003615Uncharacterized protein. (465 aa)
Csa_6G517050TPR_REGION domain-containing protein. (913 aa)
Csa_5G175720Uncharacterized protein. (102 aa)
Csa_5G126730Ribosomal_L7Ae domain-containing protein. (83 aa)
Csa_5G129300Uncharacterized protein. (319 aa)
Csa_5G177130Uncharacterized protein. (923 aa)
Csa_5G138510Uncharacterized protein. (282 aa)
Csa_6G504425Uncharacterized protein. (74 aa)
Csa_5G033990Uncharacterized protein. (595 aa)
Csa_5G181460RRM domain-containing protein. (286 aa)
Csa_6G525420Uncharacterized protein. (372 aa)
Csa_6G526300Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein. (284 aa)
Csa_5G033980Uncharacterized protein. (244 aa)
Csa_5G171150Uncharacterized protein. (237 aa)
Csa_5G175900PWWP domain-containing protein. (2067 aa)
Csa_5G593360Uncharacterized protein. (659 aa)
Csa_5G177120PCI domain-containing protein. (1004 aa)
Csa_5G179230CPSF_A domain-containing protein. (1214 aa)
Csa_5G601580WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (581 aa)
Csa_5G608560Protein kinase domain-containing protein. (1131 aa)
Csa_5G319920Uncharacterized protein. (1061 aa)
Csa_5G623590Uncharacterized protein. (1568 aa)
Csa_5G172900Uncharacterized protein. (347 aa)
Csa_5G173440Uncharacterized protein. (504 aa)
Csa_5G177110Uncharacterized protein. (371 aa)
Csa_5G602130Nop domain-containing protein. (484 aa)
Csa_5G647360Uncharacterized protein. (707 aa)
Csa_5G266840Sm domain-containing protein. (92 aa)
Csa_4G000610Uncharacterized protein. (1004 aa)
Csa_5G598010Coilin_N domain-containing protein. (542 aa)
Csa_4G006470Ubiquitin_4 domain-containing protein. (243 aa)
Csa_5G602160RRM domain-containing protein. (266 aa)
Csa_4G025080Cir_N domain-containing protein. (417 aa)
Csa_5G608300Uncharacterized protein. (313 aa)
Csa_4G046730Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2. (188 aa)
Csa_4G050790Uncharacterized protein. (826 aa)
Csa_4G102290Uncharacterized protein. (616 aa)
Csa_4G110070TOG domain-containing protein. (1262 aa)
Csa_4G129020Nuclear cap-binding protein subunit 2. (257 aa)
Csa_5G608340GCFC domain-containing protein. (947 aa)
Csa_4G016410Uncharacterized protein. (714 aa)
Csa_5G650610Uncharacterized protein. (939 aa)
Csa_4G192160Uncharacterized protein. (624 aa)
Csa_4G491190Uncharacterized protein. (500 aa)
Csa_4G607050RRM domain-containing protein. (419 aa)
Csa_4G308540Uncharacterized protein. (395 aa)
Csa_4G623900Sm domain-containing protein. (61 aa)
Csa_4G644700Uncharacterized protein. (985 aa)
Csa_4G578870MFAP1 domain-containing protein. (433 aa)
Csa_3G063650Uncharacterized protein. (376 aa)
Csa_4G488690Uncharacterized protein. (52 aa)
LSM4-2U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (244 aa)
Csa_4G652840Ubiquitin_4 domain-containing protein. (181 aa)
Csa_4G664540Uncharacterized protein. (276 aa)
Csa_3G088960WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (277 aa)
Csa_3G111250Uncharacterized protein. (958 aa)
Csa_3G149880Uncharacterized protein. (473 aa)
Csa_4G658560Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3; Core component of the spliceosomal U1, U2, U4 and U5 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), the building blocks of the spliceosome. (132 aa)
Csa_3G171110Uncharacterized protein. (103 aa)
Csa_3G055970Uncharacterized protein. (228 aa)
Csa_3G134680Uncharacterized protein. (522 aa)
Csa_3G134970Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_3G257080Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (715 aa)
Csa_3G063660Uncharacterized protein. (367 aa)
Csa_3G168950Uncharacterized protein. (2175 aa)
Csa_3G119350Uncharacterized protein. (253 aa)
Csa_3G636980NmrA domain-containing protein. (312 aa)
LSM5U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5; Plays a role in U6 snRNP assembly and function. Binds to the 3' end of U6 snRNA. (87 aa)
Csa_3G135040Slu7 domain-containing protein. (540 aa)
Csa_3G748150Uncharacterized protein. (681 aa)
Csa_3G625100LAGLIDADG_2 domain-containing protein. (798 aa)
Csa_3G636410G-patch domain-containing protein. (500 aa)
Csa_3G851900Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1; Involved in splicing regulation. Facilitates post- transcriptional gene silencing (PTGS) by limiting the degradation of transgene aberrant RNAs by the RNA quality control (RQC) machinery, thus favoring their entry into cytoplasmic siRNA bodies where they can trigger PTGS. Does not participate in the production of small RNAs. Belongs to the snRNP core protein family. (114 aa)
Csa_3G603040Matrin-type domain-containing protein. (508 aa)
Csa_3G743440Matrin-type domain-containing protein. (341 aa)
Csa_3G792040CPSF_A domain-containing protein. (1376 aa)
Csa_3G881900Uncharacterized protein. (192 aa)
Csa_2G006160Ribonucloprotein; Common component of the spliceosome and rRNA processing machinery; Belongs to the eukaryotic ribosomal protein eL8 family. (128 aa)
Csa_3G822240Uncharacterized protein. (702 aa)
Csa_2G020930Slu7 domain-containing protein. (536 aa)
Csa_2G013240Uncharacterized protein. (1218 aa)
Csa_3G790440Uncharacterized protein. (561 aa)
Csa_3G792060RRM domain-containing protein. (217 aa)
Csa_2G075290RRM domain-containing protein. (253 aa)
Csa_3G877630Ubiquitin-like domain-containing protein. (277 aa)
Csa_2G062630Uncharacterized protein. (362 aa)
Csa_2G009370Tr-type G domain-containing protein. (1090 aa)
Csa_2G00990SKIP_SNW domain-containing protein. (605 aa)
Csa_2G270830Uncharacterized protein. (315 aa)
Csa_2G349690Uncharacterized protein. (644 aa)
Csa_2G061560SKIP_SNW domain-containing protein. (603 aa)
Csa_2G099460Uncharacterized protein. (335 aa)
Csa_2G247040RRM domain-containing protein. (160 aa)
Csa_2G287060Uncharacterized protein. (142 aa)
Csa_2G033890U1-type domain-containing protein. (202 aa)
Csa_2G404860Uncharacterized protein. (809 aa)
Csa_2G075450PSP domain-containing protein. (580 aa)
Csa_2G431100G-patch domain-containing protein. (871 aa)
Csa_1G004190G-patch domain-containing protein. (465 aa)
Csa_1G025140Uncharacterized protein. (1118 aa)
Csa_2G345920RRM domain-containing protein. (251 aa)
Csa_2G382800DBR1 domain-containing protein. (413 aa)
Csa_2G349650Coilin_N domain-containing protein. (553 aa)
Csa_1G045630Uncharacterized protein. (535 aa)
Csa_2G435470Uncharacterized protein. (307 aa)
Csa_1G144280Uncharacterized protein. (532 aa)
Csa_1G153010Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_1G126050Ubiquitin-like domain-containing protein. (73 aa)
Csa_2G395940Uncharacterized protein. (135 aa)
LSM8U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8; Plays role in pre-mRNA splicing as component of the U4/U6-U5 tri-snRNP complex that is involved in spliceosome assembly, and as component of the precatalytic spliceosome (spliceosome B complex). The heptameric LSM2-8 complex binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (98 aa)
Csa_1G231020Ubiquitin_4 domain-containing protein. (129 aa)
Csa_1G045770Uncharacterized protein. (366 aa)
Csa_1G185102Uncharacterized protein. (550 aa)
Csa_2G428990Uncharacterized protein. (556 aa)
Csa_1G269330Rtf2 domain-containing protein. (386 aa)
Csa_1G320360Uncharacterized protein. (98 aa)
Csa_1G418250WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (366 aa)
Csa_1G418790Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_1G460000Uncharacterized protein. (924 aa)
Csa_1G532280Uncharacterized protein. (110 aa)
Csa_1G145960Uncharacterized protein. (326 aa)
Csa_1G538260Uncharacterized protein. (116 aa)
Csa_1G637960J domain-containing protein. (251 aa)
Csa_1G538270Uncharacterized protein. (560 aa)
Csa_1G682130Uncharacterized protein. (394 aa)
Csa_1G630290RRM domain-containing protein. (403 aa)
Csa_1G427510Uncharacterized protein. (379 aa)
Csa_1G616300MIF4G domain-containing protein. (864 aa)
Csa_1G633380Uncharacterized protein. (454 aa)
Csa_1G682630Uncharacterized protein. (516 aa)
Csa_1G569330Uncharacterized protein. (322 aa)
Csa_1G588540Uncharacterized protein. (624 aa)
Your Current Organism:
Cucumis sativus
NCBI taxonomy Id: 3659
Other names: C. sativus, Cucumis sativus L., cucumber, cucumbers
Server load: low (26%) [HD]