STRINGSTRING
Csa_4G488690 Csa_4G488690 Csa_3G125010 Csa_3G125010 Csa_4G652840 Csa_4G652840 Csa_4G646250 Csa_4G646250 Csa_4G658560 Csa_4G658560 Csa_3G134680 Csa_3G134680 Csa_3G145760 Csa_3G145760 Csa_3G063660 Csa_3G063660 Csa_3G119350 Csa_3G119350 Csa_3G135040 Csa_3G135040 Csa_3G172960 Csa_3G172960 Csa_3G851900 Csa_3G851900 Csa_3G697950 Csa_3G697950 Csa_3G603040 Csa_3G603040 Csa_3G743440 Csa_3G743440 Csa_2G020930 Csa_2G020930 Csa_2G033300 Csa_2G033300 Csa_2G036090 Csa_2G036090 Csa_3G777000 Csa_3G777000 Csa_2G100030 Csa_2G100030 Csa_2G100010 Csa_2G100010 Csa_2G009370 Csa_2G009370 Csa_2G033290 Csa_2G033290 Csa_2G270830 Csa_2G270830 Csa_2G372800 Csa_2G372800 Csa_2G172520 Csa_2G172520 Csa_2G404860 Csa_2G404860 Csa_2G075450 Csa_2G075450 Csa_2G431100 Csa_2G431100 Csa_2G379180 Csa_2G379180 Csa_2G345920 Csa_2G345920 Csa_1G043260 Csa_1G043260 Csa_1G144280 Csa_1G144280 Csa_1G153010 Csa_1G153010 Csa_1G266150 Csa_1G266150 Csa_1G460000 Csa_1G460000 Csa_1G532280 Csa_1G532280 Csa_1G560720 Csa_1G560720 Csa_1G528490 Csa_1G528490 Csa_1G537370 Csa_1G537370 Csa_1G459490 Csa_1G459490 Csa_1G560650 Csa_1G560650 Csa_1G588540 Csa_1G588540 Csa_5G138510 Csa_5G138510 Csa_5G033990 Csa_5G033990 Csa_5G528420 Csa_5G528420 Csa_5G033980 Csa_5G033980 Csa_5G175900 Csa_5G175900 Csa_5G601580 Csa_5G601580 Csa_5G319920 Csa_5G319920 Csa_5G528410 Csa_5G528410 Csa_5G177110 Csa_5G177110 Csa_5G635380 Csa_5G635380 Csa_5G348070 Csa_5G348070 Csa_5G429980 Csa_5G429980 Csa_4G025080 Csa_4G025080 Csa_4G015830 Csa_4G015830 Csa_5G608300 Csa_5G608300 Csa_6G517050 Csa_6G517050 Csa_4G110070 Csa_4G110070 Csa_5G608340 Csa_5G608340 Csa_4G022880 Csa_4G022880 Csa_4G491190 Csa_4G491190 Csa_4G638320 Csa_4G638320 Csa_4G578870 Csa_4G578870 Csa_3G063650 Csa_3G063650 Csa_5G003615 Csa_5G003615 Csa_6G517220 Csa_6G517220 Csa_6G499730 Csa_6G499730 Csa_6G450960 Csa_6G450960 Csa_6G430680 Csa_6G430680 Csa_6G521610 Csa_6G521610 Csa_6G452700 Csa_6G452700 Csa_6G502610 Csa_6G502610 Csa_6G366550 Csa_6G366550 Csa_6G088040 Csa_6G088040 Csa_6G139780 Csa_6G139780 Csa_6G118290 Csa_6G118290 Csa_7G431430 Csa_7G431430 Csa_6G022350 Csa_6G022350 Csa_7G235750 Csa_7G235750 Csa_6G045040 Csa_6G045040 Csa_7G388420 Csa_7G388420 Csa_7G062820 Csa_7G062820 Csa_7G239560 Csa_7G239560 Csa_7G390140 Csa_7G390140 Csa_7G251640 Csa_7G251640 Csa_7G201920 Csa_7G201920 Csa_7G033370 Csa_7G033370
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
Csa_4G488690Uncharacterized protein. (52 aa)
Csa_3G125010Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (194 aa)
Csa_4G652840Ubiquitin_4 domain-containing protein. (181 aa)
Csa_4G646250PPIase cyclophilin-type domain-containing protein. (494 aa)
Csa_4G658560Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3; Core component of the spliceosomal U1, U2, U4 and U5 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), the building blocks of the spliceosome. (132 aa)
Csa_3G134680Uncharacterized protein. (522 aa)
Csa_3G145760DUF3700 domain-containing protein. (250 aa)
Csa_3G063660Uncharacterized protein. (367 aa)
Csa_3G119350Uncharacterized protein. (253 aa)
Csa_3G135040Slu7 domain-containing protein. (540 aa)
Csa_3G172960Uncharacterized protein. (379 aa)
Csa_3G851900Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1; Involved in splicing regulation. Facilitates post- transcriptional gene silencing (PTGS) by limiting the degradation of transgene aberrant RNAs by the RNA quality control (RQC) machinery, thus favoring their entry into cytoplasmic siRNA bodies where they can trigger PTGS. Does not participate in the production of small RNAs. Belongs to the snRNP core protein family. (114 aa)
Csa_3G697950Sm domain-containing protein. (99 aa)
Csa_3G603040Matrin-type domain-containing protein. (508 aa)
Csa_3G743440Matrin-type domain-containing protein. (341 aa)
Csa_2G020930Slu7 domain-containing protein. (536 aa)
Csa_2G033300Uncharacterized protein. (255 aa)
Csa_2G036090Uncharacterized protein. (517 aa)
Csa_3G777000Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_2G100030PPIase cyclophilin-type domain-containing protein. (133 aa)
Csa_2G100010PPIase cyclophilin-type domain-containing protein. (125 aa)
Csa_2G009370Tr-type G domain-containing protein. (1090 aa)
Csa_2G033290Uncharacterized protein. (164 aa)
Csa_2G270830Uncharacterized protein. (315 aa)
Csa_2G372800Poly [ADP-ribose] polymerase. (465 aa)
Csa_2G172520Uncharacterized protein. (1024 aa)
Csa_2G404860Uncharacterized protein. (809 aa)
Csa_2G075450PSP domain-containing protein. (580 aa)
Csa_2G431100G-patch domain-containing protein. (871 aa)
Csa_2G379180Cwf21 domain-containing protein. (906 aa)
Csa_2G345920RRM domain-containing protein. (251 aa)
Csa_1G043260Uncharacterized protein. (194 aa)
Csa_1G144280Uncharacterized protein. (532 aa)
Csa_1G153010Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_1G266150Uncharacterized protein. (783 aa)
Csa_1G460000Uncharacterized protein. (924 aa)
Csa_1G532280Uncharacterized protein. (110 aa)
Csa_1G560720G-patch domain-containing protein. (299 aa)
Csa_1G528490RRM domain-containing protein. (367 aa)
Csa_1G537370Ubiquitin-like domain-containing protein. (277 aa)
Csa_1G459490X8 domain-containing protein. (281 aa)
Csa_1G560650C3H1-type domain-containing protein. (156 aa)
Csa_1G588540Uncharacterized protein. (624 aa)
Csa_5G138510Uncharacterized protein. (282 aa)
Csa_5G033990Uncharacterized protein. (595 aa)
Csa_5G528420Uncharacterized protein. (213 aa)
Csa_5G033980Uncharacterized protein. (244 aa)
Csa_5G175900PWWP domain-containing protein. (2067 aa)
Csa_5G601580WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (581 aa)
Csa_5G319920Uncharacterized protein. (1061 aa)
Csa_5G528410Uncharacterized protein. (547 aa)
Csa_5G177110Uncharacterized protein. (371 aa)
Csa_5G635380Protein arginine methyltransferase NDUFAF7; Arginine methyltransferase involved in the assembly or stability of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase complex (complex I). (493 aa)
Csa_5G348070Uncharacterized protein. (363 aa)
Csa_5G429980DUF1716 domain-containing protein. (526 aa)
Csa_4G025080Cir_N domain-containing protein. (417 aa)
Csa_4G015830PORR domain-containing protein. (484 aa)
Csa_5G608300Uncharacterized protein. (313 aa)
Csa_6G517050TPR_REGION domain-containing protein. (913 aa)
Csa_4G110070TOG domain-containing protein. (1262 aa)
Csa_5G608340GCFC domain-containing protein. (947 aa)
Csa_4G022880Uncharacterized protein. (777 aa)
Csa_4G491190Uncharacterized protein. (500 aa)
Csa_4G638320DUF3700 domain-containing protein. (254 aa)
Csa_4G578870MFAP1 domain-containing protein. (433 aa)
Csa_3G063650Uncharacterized protein. (376 aa)
Csa_5G003615Uncharacterized protein. (465 aa)
Csa_6G517220DUF3700 domain-containing protein. (256 aa)
Csa_6G499730Uncharacterized protein. (741 aa)
Csa_6G450960Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_6G430680RRM domain-containing protein. (125 aa)
Csa_6G521610X8 domain-containing protein. (279 aa)
Csa_6G452700Small nuclear ribonucleoprotein G. (80 aa)
Csa_6G502610RRM domain-containing protein. (505 aa)
Csa_6G366550RRM domain-containing protein. (171 aa)
Csa_6G088040Uncharacterized protein. (831 aa)
Csa_6G139780X8 domain-containing protein. (186 aa)
Csa_6G118290RRM domain-containing protein. (357 aa)
Csa_7G431430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_6G022350U2 snRNP auxiliary factor large subunit; Necessary for the splicing of pre-mRNA. Belongs to the splicing factor SR family. (587 aa)
Csa_7G235750X8 domain-containing protein. (254 aa)
Csa_6G045040Uncharacterized protein. (671 aa)
Csa_7G388420SFM domain-containing protein. (420 aa)
Csa_7G062820RRM domain-containing protein. (283 aa)
Csa_7G239560Uncharacterized protein. (143 aa)
Csa_7G390140U1 small nuclear ribonucleoprotein C; Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates commitment or early (E) complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region. (197 aa)
Csa_7G251640X8 domain-containing protein. (222 aa)
Csa_7G201920Tr-type G domain-containing protein. (988 aa)
Csa_7G033370Uncharacterized protein. (509 aa)
Your Current Organism:
Cucumis sativus
NCBI taxonomy Id: 3659
Other names: C. sativus, Cucumis sativus L., cucumber, cucumbers
Server load: low (34%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.