STRINGSTRING
Csa_7G390040 Csa_7G390040 Csa_7G184650 Csa_7G184650 Csa_3G180370 Csa_3G180370 Csa_3G166240 Csa_3G166240 Csa_3G375720 Csa_3G375720 Csa_3G129690 Csa_3G129690 Csa_6G366550 Csa_6G366550 Csa_3G134680 Csa_3G134680 Csa_3G143540 Csa_3G143540 Csa_3G036500 Csa_3G036500 Csa_3G123210 Csa_3G123210 Csa_4G651950 Csa_4G651950 Csa_4G338420 Csa_4G338420 Csa_4G165910 Csa_4G165910 Csa_4G031020 Csa_4G031020 Csa_6G486670 Csa_6G486670 Csa_6G490020 Csa_6G490020 Csa_6G411200 Csa_6G411200 Csa_6G517270 Csa_6G517270 Csa_5G152930 Csa_5G152930 Csa_6G517050 Csa_6G517050 Csa_6G517340 Csa_6G517340 Csa_5G169080 Csa_5G169080 Csa_5G312340 Csa_5G312340 Csa_5G600940 Csa_5G600940 Csa_5G623590 Csa_5G623590 Csa_5G600925 Csa_5G600925 Csa_4G294920 Csa_4G294920 Csa_5G643990 Csa_5G643990 Csa_4G338430 Csa_4G338430 Csa_4G011050 Csa_4G011050 Csa_4G016400 Csa_4G016400 Csa_4G274790 Csa_4G274790 RpoC1 RpoC1 Csa_1G702030 Csa_1G702030 Csa_1G537440 Csa_1G537440 Csa_1G435820 Csa_1G435820 Csa_1G257900 Csa_1G257900 Csa_1G043050 Csa_1G043050 Csa_1G435830 Csa_1G435830 Csa_1G043180 Csa_1G043180 Csa_2G348875 Csa_2G348875 Csa_2G384980 Csa_2G384980 Csa_2G378560 Csa_2G378560 Csa_2G072450 Csa_2G072450 Csa_2G292740 Csa_2G292740 Csa_2G372800 Csa_2G372800 Csa_2G354740 Csa_2G354740 Csa_2G193330 Csa_2G193330 Csa_2G147910 Csa_2G147910 Csa_2G093850 Csa_2G093850 Csa_3G877600 Csa_3G877600 Csa_3G855380 Csa_3G855380 Csa_3G815480 Csa_3G815480 Csa_3G822200 Csa_3G822200 Csa_3G690810 Csa_3G690810 Csa_7G374590 Csa_7G374590 Csa_6G087830 Csa_6G087830 Csa_7G426580 Csa_7G426580 Csa_6G008050 Csa_6G008050 Csa_7G431430 Csa_7G431430 Csa_6G127410 Csa_6G127410 Csa_6G014610 Csa_6G014610 Csa_6G476110 Csa_6G476110 Csa_6G170410 Csa_6G170410 Csa_6G104090 Csa_6G104090 Csa_6G014700 Csa_6G014700 Csa_6G014650 Csa_6G014650
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
Csa_7G390040Helicase ATP-binding domain-containing protein. (758 aa)
Csa_7G184650MPN domain-containing protein. (300 aa)
Csa_3G180370Uncharacterized protein. (143 aa)
Csa_3G166240DNA-directed RNA polymerase subunit; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Belongs to the archaeal rpoM/eukaryotic RPA12/RPB9/RPC11 RNA polymerase family. (114 aa)
Csa_3G375720Uncharacterized protein. (1155 aa)
Csa_3G129690Uncharacterized protein. (445 aa)
Csa_6G366550RRM domain-containing protein. (171 aa)
Csa_3G134680Uncharacterized protein. (522 aa)
Csa_3G143540Uncharacterized protein. (190 aa)
Csa_3G036500Uncharacterized protein. (70 aa)
Csa_3G123210PCI domain-containing protein. (450 aa)
Csa_4G651950DNA-directed RNA polymerase subunit beta; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. (1197 aa)
Csa_4G338420BSD domain-containing protein. (388 aa)
Csa_4G165910Uncharacterized protein. (233 aa)
Csa_4G031020Uncharacterized protein; Belongs to the eukaryotic RPB8 RNA polymerase subunit family. (146 aa)
Csa_6G486670TFIIS N-terminal domain-containing protein. (345 aa)
Csa_6G490020CYCLIN domain-containing protein; Belongs to the cyclin family. (332 aa)
Csa_6G411200CSN8_PSD8_EIF3K domain-containing protein. (119 aa)
Csa_6G517270RNA polymerase II transcription factor B subunit 2; Component of the general transcription and DNA repair factor IIH (TFIIH) core complex which is involved in general and transcription-coupled nucleotide excision repair (NER) of damaged DNA. Belongs to the TFB2 family. (451 aa)
Csa_5G152930Uncharacterized protein. (821 aa)
Csa_6G517050TPR_REGION domain-containing protein. (913 aa)
Csa_6G517340DNA-directed RNA polymerase subunit beta; DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. (1248 aa)
Csa_5G169080General transcription factor IIH subunit. (423 aa)
Csa_5G312340Uncharacterized protein. (176 aa)
Csa_5G600940Uncharacterized protein. (71 aa)
Csa_5G623590Uncharacterized protein. (1568 aa)
Csa_5G600925Ubiquitin-like domain-containing protein. (188 aa)
Csa_4G294920SANTA domain-containing protein. (295 aa)
Csa_5G643990RPOL4c domain-containing protein. (121 aa)
Csa_4G338430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_4G011050Uncharacterized protein; Belongs to the eukaryotic RPB8 RNA polymerase subunit family. (144 aa)
Csa_4G016400SANTA domain-containing protein. (293 aa)
Csa_4G274790PCI domain-containing protein. (323 aa)
RpoC1Uncharacterized protein. (84 aa)
Csa_1G702030Uncharacterized protein. (205 aa)
Csa_1G537440CPSF_A domain-containing protein. (1041 aa)
Csa_1G435820CULLIN_2 domain-containing protein; Belongs to the cullin family. (540 aa)
Csa_1G257900MAT1 domain-containing protein. (189 aa)
Csa_1G043050Uncharacterized protein. (1164 aa)
Csa_1G435830Cullin domain-containing protein; Belongs to the cullin family. (278 aa)
Csa_1G043180Uncharacterized protein. (51 aa)
Csa_2G348875Ubiquitin extension protein. (156 aa)
Csa_2G384980Uncharacterized protein. (71 aa)
Csa_2G378560MPN domain-containing protein. (365 aa)
Csa_2G072450Uncharacterized protein. (295 aa)
Csa_2G292740Uncharacterized protein. (305 aa)
Csa_2G372800Poly [ADP-ribose] polymerase. (465 aa)
Csa_2G354740WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (446 aa)
Csa_2G193330Uncharacterized protein. (175 aa)
Csa_2G147910Uncharacterized protein. (526 aa)
Csa_2G093850RPOLD domain-containing protein. (320 aa)
Csa_3G877600Uncharacterized protein. (142 aa)
Csa_3G855380PCI domain-containing protein. (443 aa)
Csa_3G815480Uncharacterized protein. (54 aa)
Csa_3G822200Uncharacterized protein. (227 aa)
Csa_3G690810RNA_pol_L_2 domain-containing protein. (116 aa)
Csa_7G374590Uncharacterized protein. (207 aa)
Csa_6G087830Uncharacterized protein. (648 aa)
Csa_7G426580RNA_pol_L_2 domain-containing protein. (162 aa)
Csa_6G008050PCI domain-containing protein. (486 aa)
Csa_7G431430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_6G127410Uncharacterized protein. (911 aa)
Csa_6G014610Uncharacterized protein. (369 aa)
Csa_6G476110Uncharacterized protein. (1093 aa)
Csa_6G170410Uncharacterized protein. (207 aa)
Csa_6G104090PCI domain-containing protein. (259 aa)
Csa_6G014700DUF4101 domain-containing protein. (817 aa)
Csa_6G014650RPOL4c domain-containing protein. (138 aa)
Your Current Organism:
Cucumis sativus
NCBI taxonomy Id: 3659
Other names: C. sativus, Cucumis sativus L., cucumber, cucumbers
Server load: low (32%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.