STRINGSTRING
Csa_7G206940 Csa_7G206940 Csa_7G278740 Csa_7G278740 Csa_7G390140 Csa_7G390140 Csa_7G397040 Csa_7G397040 Csa_7G375800 Csa_7G375800 Csa_7G058610 Csa_7G058610 Csa_7G312930 Csa_7G312930 Csa_7G062820 Csa_7G062820 Csa_7G388420 Csa_7G388420 Csa_7G412850 Csa_7G412850 LSM3 LSM3 Csa_6G022350 Csa_6G022350 Csa_7G447710 Csa_7G447710 Csa_6G089220 Csa_6G089220 LSM4 LSM4 Csa_7G428250 Csa_7G428250 Csa_7G431430 Csa_7G431430 Csa_6G193610 Csa_6G193610 Csa_6G319790 Csa_6G319790 Csa_6G104100 Csa_6G104100 Csa_6G450380 Csa_6G450380 Csa_6G502610 Csa_6G502610 Csa_6G404170 Csa_6G404170 Csa_6G452700 Csa_6G452700 Csa_6G430680 Csa_6G430680 Csa_6G450960 Csa_6G450960 Csa_6G520320 Csa_6G520320 Csa_6G517050 Csa_6G517050 Csa_5G177130 Csa_5G177130 Csa_6G507340 Csa_6G507340 Csa_5G181460 Csa_5G181460 Csa_6G525420 Csa_6G525420 Csa_5G550190 Csa_5G550190 Csa_6G526300 Csa_6G526300 Csa_5G179230 Csa_5G179230 Csa_5G601600 Csa_5G601600 Csa_5G601580 Csa_5G601580 Csa_5G514500 Csa_5G514500 Csa_5G623590 Csa_5G623590 Csa_5G177110 Csa_5G177110 Csa_5G602130 Csa_5G602130 Csa_5G266840 Csa_5G266840 Csa_4G000610 Csa_4G000610 Csa_5G348070 Csa_5G348070 Csa_5G588760 Csa_5G588760 Csa_4G004270 Csa_4G004270 Csa_5G407100 Csa_5G407100 Csa_5G429980 Csa_5G429980 Csa_5G624450 Csa_5G624450 Csa_5G512930 Csa_5G512930 Csa_4G046730 Csa_4G046730 Csa_4G031040 Csa_4G031040 Csa_5G622570 Csa_5G622570 Csa_4G097700 Csa_4G097700 Csa_4G110070 Csa_4G110070 Csa_4G129020 Csa_4G129020 Csa_4G001840 Csa_4G001840 Csa_4G295440 Csa_4G295440 Csa_4G031080 Csa_4G031080 Csa_5G648670 Csa_5G648670 Csa_5G650610 Csa_5G650610 Csa_4G083660 Csa_4G083660 Csa_4G623900 Csa_4G623900 Csa_4G644700 Csa_4G644700 Csa_3G063650 Csa_3G063650 Csa_4G664540 Csa_4G664540 Csa_3G151370 Csa_3G151370 Csa_4G658560 Csa_4G658560 Csa_3G055970 Csa_3G055970 Csa_3G061010 Csa_3G061010 Csa_3G134680 Csa_3G134680 Csa_3G302100 Csa_3G302100 Csa_3G134970 Csa_3G134970 Csa_3G257080 Csa_3G257080 Csa_3G063660 Csa_3G063660 Csa_3G077650 Csa_3G077650 Csa_3G168950 Csa_3G168950 Csa_3G116780 Csa_3G116780 Csa_3G119350 Csa_3G119350 LSM5 LSM5 Csa_3G654480 Csa_3G654480 Csa_3G135040 Csa_3G135040 Csa_3G151380 Csa_3G151380 Csa_3G172960 Csa_3G172960 Csa_3G851900 Csa_3G851900 Csa_3G697950 Csa_3G697950 Csa_3G603040 Csa_3G603040 Csa_3G743440 Csa_3G743440 Csa_3G792040 Csa_3G792040 Csa_3G809410 Csa_3G809410 Csa_3G881900 Csa_3G881900 Csa_2G006160 Csa_2G006160 Csa_3G822240 Csa_3G822240 Csa_2G020930 Csa_2G020930 Csa_3G848820 Csa_3G848820 Csa_2G033300 Csa_2G033300 Csa_3G838660 Csa_3G838660 Csa_2G013240 Csa_2G013240 Csa_2G036090 Csa_2G036090 Csa_3G777640 Csa_3G777640 Csa_3G792060 Csa_3G792060 Csa_2G009370 Csa_2G009370 Csa_2G00990 Csa_2G00990 Csa_2G270830 Csa_2G270830 Csa_2G070310 Csa_2G070310 Csa_2G061560 Csa_2G061560 Csa_2G172520 Csa_2G172520 Csa_2G287060 Csa_2G287060 Csa_2G033890 Csa_2G033890 Csa_2G382730 Csa_2G382730 Csa_2G404860 Csa_2G404860 Csa_2G075450 Csa_2G075450 Csa_2G350990 Csa_2G350990 Csa_1G025950 Csa_1G025950 Csa_1G025140 Csa_1G025140 Csa_2G297150 Csa_2G297150 Csa_2G324460 Csa_2G324460 Csa_1G042680 Csa_1G042680 Csa_2G345920 Csa_2G345920 Csa_1G039190 Csa_1G039190 Csa_1G043260 Csa_1G043260 Csa_1G004080 Csa_1G004080 Csa_2G381720 Csa_2G381720 Csa_1G144280 Csa_1G144280 Csa_1G153010 Csa_1G153010 LSM8 LSM8 Csa_1G185102 Csa_1G185102 Csa_1G423230 Csa_1G423230 Csa_1G418790 Csa_1G418790 Csa_1G012660 Csa_1G012660 Csa_1G480690 Csa_1G480690 Csa_1G532280 Csa_1G532280 Csa_1G145960 Csa_1G145960 Csa_1G682130 Csa_1G682130 Csa_1G533590 Csa_1G533590 Csa_1G630290 Csa_1G630290 Csa_1G616300 Csa_1G616300 Csa_1G569330 Csa_1G569330 Csa_1G616290 Csa_1G616290 Csa_2G122520 Csa_2G122520
Nodes:
Network nodes represent proteins
splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.
Node Color
colored nodes:
query proteins and first shell of interactors
white nodes:
second shell of interactors
Node Content
empty nodes:
proteins of unknown 3D structure
filled nodes:
a 3D structure is known or predicted
Edges:
Edges represent protein-protein associations
associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.
Known Interactions
from curated databases
experimentally determined
Predicted Interactions
gene neighborhood
gene fusions
gene co-occurrence
Others
textmining
co-expression
protein homology
Your Input:
Csa_7G206940Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_7G278740Uncharacterized protein. (347 aa)
Csa_7G390140U1 small nuclear ribonucleoprotein C; Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates commitment or early (E) complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region. (197 aa)
Csa_7G397040Uncharacterized protein. (274 aa)
Csa_7G375800Uncharacterized protein. (1298 aa)
Csa_7G058610Uncharacterized protein. (211 aa)
Csa_7G312930Uncharacterized protein; Belongs to the heat shock protein 70 family. (666 aa)
Csa_7G062820RRM domain-containing protein. (283 aa)
Csa_7G388420SFM domain-containing protein. (420 aa)
Csa_7G412850Uncharacterized protein. (732 aa)
LSM3U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (97 aa)
Csa_6G022350U2 snRNP auxiliary factor large subunit; Necessary for the splicing of pre-mRNA. Belongs to the splicing factor SR family. (587 aa)
Csa_7G447710Uncharacterized protein. (845 aa)
Csa_6G089220LRRcap domain-containing protein. (220 aa)
LSM4U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4; Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (149 aa)
Csa_7G428250Sm-like protein LSM2; Component of LSM protein complexes, which are involved in RNA processing. (93 aa)
Csa_7G431430Uncharacterized protein. (303 aa)
Csa_6G193610RRM domain-containing protein. (237 aa)
Csa_6G319790WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (476 aa)
Csa_6G104100Uncharacterized protein. (1023 aa)
Csa_6G450380Uncharacterized protein. (317 aa)
Csa_6G502610RRM domain-containing protein. (505 aa)
Csa_6G404170WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (569 aa)
Csa_6G452700Small nuclear ribonucleoprotein G. (80 aa)
Csa_6G430680RRM domain-containing protein. (125 aa)
Csa_6G450960Uncharacterized protein. (145 aa)
Csa_6G520320Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_6G517050TPR_REGION domain-containing protein. (913 aa)
Csa_5G177130Uncharacterized protein. (923 aa)
Csa_6G507340RRM domain-containing protein. (244 aa)
Csa_5G181460RRM domain-containing protein. (286 aa)
Csa_6G525420Uncharacterized protein. (372 aa)
Csa_5G550190Uncharacterized protein. (1887 aa)
Csa_6G526300Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein. (284 aa)
Csa_5G179230CPSF_A domain-containing protein. (1214 aa)
Csa_5G601600Uncharacterized protein. (968 aa)
Csa_5G601580WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (581 aa)
Csa_5G514500Uncharacterized protein; Belongs to the heat shock protein 70 family. (648 aa)
Csa_5G623590Uncharacterized protein. (1568 aa)
Csa_5G177110Uncharacterized protein. (371 aa)
Csa_5G602130Nop domain-containing protein. (484 aa)
Csa_5G266840Sm domain-containing protein. (92 aa)
Csa_4G000610Uncharacterized protein. (1004 aa)
Csa_5G348070Uncharacterized protein. (363 aa)
Csa_5G588760WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (344 aa)
Csa_4G004270Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (777 aa)
Csa_5G407100Uncharacterized protein. (614 aa)
Csa_5G429980DUF1716 domain-containing protein. (526 aa)
Csa_5G624450Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (191 aa)
Csa_5G512930Heat shock protein 70; Belongs to the heat shock protein 70 family. (652 aa)
Csa_4G046730Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2. (188 aa)
Csa_4G031040SAP domain-containing protein. (794 aa)
Csa_5G622570Uncharacterized protein. (248 aa)
Csa_4G097700Uncharacterized protein. (1735 aa)
Csa_4G110070TOG domain-containing protein. (1262 aa)
Csa_4G129020Nuclear cap-binding protein subunit 2. (257 aa)
Csa_4G001840Uncharacterized protein. (242 aa)
Csa_4G295440Heat shock protein 70; Belongs to the heat shock protein 70 family. (647 aa)
Csa_4G031080Uncharacterized protein. (421 aa)
Csa_5G648670Uncharacterized protein. (485 aa)
Csa_5G650610Uncharacterized protein. (939 aa)
Csa_4G083660Uncharacterized protein. (434 aa)
Csa_4G623900Sm domain-containing protein. (61 aa)
Csa_4G644700Uncharacterized protein. (985 aa)
Csa_3G063650Uncharacterized protein. (376 aa)
Csa_4G664540Uncharacterized protein. (276 aa)
Csa_3G151370Uncharacterized protein. (1193 aa)
Csa_4G658560Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3; Core component of the spliceosomal U1, U2, U4 and U5 small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), the building blocks of the spliceosome. (132 aa)
Csa_3G055970Uncharacterized protein. (228 aa)
Csa_3G061010WD_REPEATS_REGION domain-containing protein. (314 aa)
Csa_3G134680Uncharacterized protein. (522 aa)
Csa_3G302100RRM domain-containing protein. (278 aa)
Csa_3G134970Splicing factor subunit; Belongs to the SF3B5 family. (87 aa)
Csa_3G257080Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (715 aa)
Csa_3G063660Uncharacterized protein. (367 aa)
Csa_3G077650Uncharacterized protein. (712 aa)
Csa_3G168950Uncharacterized protein. (2175 aa)
Csa_3G116780Uncharacterized protein. (152 aa)
Csa_3G119350Uncharacterized protein. (253 aa)
LSM5U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5; Plays a role in U6 snRNP assembly and function. Binds to the 3' end of U6 snRNA. (87 aa)
Csa_3G654480Uncharacterized protein. (410 aa)
Csa_3G135040Slu7 domain-containing protein. (540 aa)
Csa_3G151380Uncharacterized protein. (1253 aa)
Csa_3G172960Uncharacterized protein. (379 aa)
Csa_3G851900Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1; Involved in splicing regulation. Facilitates post- transcriptional gene silencing (PTGS) by limiting the degradation of transgene aberrant RNAs by the RNA quality control (RQC) machinery, thus favoring their entry into cytoplasmic siRNA bodies where they can trigger PTGS. Does not participate in the production of small RNAs. Belongs to the snRNP core protein family. (114 aa)
Csa_3G697950Sm domain-containing protein. (99 aa)
Csa_3G603040Matrin-type domain-containing protein. (508 aa)
Csa_3G743440Matrin-type domain-containing protein. (341 aa)
Csa_3G792040CPSF_A domain-containing protein. (1376 aa)
Csa_3G809410Uncharacterized protein. (335 aa)
Csa_3G881900Uncharacterized protein. (192 aa)
Csa_2G006160Ribonucloprotein; Common component of the spliceosome and rRNA processing machinery; Belongs to the eukaryotic ribosomal protein eL8 family. (128 aa)
Csa_3G822240Uncharacterized protein. (702 aa)
Csa_2G020930Slu7 domain-containing protein. (536 aa)
Csa_3G848820Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (505 aa)
Csa_2G033300Uncharacterized protein. (255 aa)
Csa_3G838660Uncharacterized protein. (840 aa)
Csa_2G013240Uncharacterized protein. (1218 aa)
Csa_2G036090Uncharacterized protein. (517 aa)
Csa_3G777640Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides; Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. (164 aa)
Csa_3G792060RRM domain-containing protein. (217 aa)
Csa_2G009370Tr-type G domain-containing protein. (1090 aa)
Csa_2G00990SKIP_SNW domain-containing protein. (605 aa)
Csa_2G270830Uncharacterized protein. (315 aa)
Csa_2G070310Uncharacterized protein; Belongs to the heat shock protein 70 family. (650 aa)
Csa_2G061560SKIP_SNW domain-containing protein. (603 aa)
Csa_2G172520Uncharacterized protein. (1024 aa)
Csa_2G287060Uncharacterized protein. (142 aa)
Csa_2G033890U1-type domain-containing protein. (202 aa)
Csa_2G382730Uncharacterized protein. (958 aa)
Csa_2G404860Uncharacterized protein. (809 aa)
Csa_2G075450PSP domain-containing protein. (580 aa)
Csa_2G350990Uncharacterized protein. (702 aa)
Csa_1G025950Uncharacterized protein. (231 aa)
Csa_1G025140Uncharacterized protein. (1118 aa)
Csa_2G297150Uncharacterized protein. (500 aa)
Csa_2G324460Uncharacterized protein. (283 aa)
Csa_1G042680Uncharacterized protein. (256 aa)
Csa_2G345920RRM domain-containing protein. (251 aa)
Csa_1G039190RRM domain-containing protein. (171 aa)
Csa_1G043260Uncharacterized protein. (194 aa)
Csa_1G004080Uncharacterized protein; Belongs to the DEAD box helicase family. (550 aa)
Csa_2G381720Uncharacterized protein. (427 aa)
Csa_1G144280Uncharacterized protein. (532 aa)
Csa_1G153010Uncharacterized protein. (145 aa)
LSM8U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8; Plays role in pre-mRNA splicing as component of the U4/U6-U5 tri-snRNP complex that is involved in spliceosome assembly, and as component of the precatalytic spliceosome (spliceosome B complex). The heptameric LSM2-8 complex binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA. (98 aa)
Csa_1G185102Uncharacterized protein. (550 aa)
Csa_1G423230SNRNP27 domain-containing protein. (232 aa)
Csa_1G418790Small nuclear ribonucleoprotein E; Associated with the spliceosome snRNP U1, U2, U4/U6 and U5. Belongs to the snRNP Sm proteins family. (88 aa)
Csa_1G012660Uncharacterized protein. (1055 aa)
Csa_1G480690RRM domain-containing protein. (250 aa)
Csa_1G532280Uncharacterized protein. (110 aa)
Csa_1G145960Uncharacterized protein. (326 aa)
Csa_1G682130Uncharacterized protein. (394 aa)
Csa_1G533590Uncharacterized protein. (491 aa)
Csa_1G630290RRM domain-containing protein. (403 aa)
Csa_1G616300MIF4G domain-containing protein. (864 aa)
Csa_1G569330Uncharacterized protein. (322 aa)
Csa_1G616290RRM domain-containing protein. (197 aa)
Csa_2G122520Chloroplast HSP70; Belongs to the heat shock protein 70 family. (707 aa)
Your Current Organism:
Cucumis sativus
NCBI taxonomy Id: 3659
Other names: C. sativus, Cucumis sativus L., cucumber, cucumbers
Server load: low (26%) [HD]
STRING is a Core Data Resource as designated by Global Biodata Coalition and ELIXIR.