(64 nodes) Heterokaryon incompatibility network (Botryotinia calthae)

Nodes:

Network nodes represent proteins

splice isoforms or post-translational modifications are collapsed, i.e. each node represents all the proteins produced by a single, protein-coding gene locus.

Node Color

colored nodes:
query proteins and first shell of interactors

white nodes:
second shell of interactors

Node Content

empty nodes:
proteins of unknown 3D structure

filled nodes:
a 3D structure is known or predicted

Edges:

Edges represent protein-protein associations

associations are meant to be specific and meaningful, i.e. proteins jointly contribute to a shared function; this does not necessarily mean they are physically binding to each other.

Known Interactions

from curated databases

experimentally determined

Predicted Interactions

gene neighborhood

gene fusions

gene co-occurrence

Others

textmining

co-expression

protein homology

Your Input:
	A0A4Y8CIT6	HET domain-containing protein. (884 aa)
	A0A4Y8D330	HET domain-containing protein. (675 aa)
	A0A4Y8D2S9	HET domain-containing protein. (847 aa)
	A0A4Y8D2Q5	HET domain-containing protein. (688 aa)
	A0A4Y8D2H4	HET domain-containing protein. (456 aa)
	A0A4Y8D1R9	HET domain-containing protein. (430 aa)
	A0A4Y8D1B3	HET domain-containing protein. (707 aa)
	A0A4Y8D0W2	HET domain-containing protein. (551 aa)
	A0A4Y8D0B3	HET domain-containing protein. (688 aa)
	A0A4Y8D009	HET domain-containing protein. (736 aa)
	A0A4Y8CZ88	HET domain-containing protein. (314 aa)
	A0A4Y8CYY3	HET domain-containing protein. (414 aa)
	A0A4Y8CY20	HET domain-containing protein. (113 aa)
	A0A4Y8CX93	HET domain-containing protein. (689 aa)
	A0A4Y8CX14	HET domain-containing protein. (624 aa)
	A0A4Y8CWZ4	HET domain-containing protein. (327 aa)
	A0A4Y8CWT7	HET domain-containing protein. (588 aa)
	A0A4Y8CWF4	HET domain-containing protein. (587 aa)
	A0A4Y8CVR1	HET domain-containing protein. (573 aa)
	A0A4Y8CVH6	HET domain-containing protein. (407 aa)
	A0A4Y8CVE7	HET domain-containing protein. (675 aa)
	A0A4Y8CUX2	Nudix hydrolase domain-containing protein; Belongs to the Nudix hydrolase family. (231 aa)
	A0A4Y8CU07	HET domain-containing protein. (653 aa)
	A0A4Y8CTL8	HET domain-containing protein. (419 aa)
	A0A4Y8CTE9	HET domain-containing protein. (760 aa)
	A0A4Y8CSZ9	HET domain-containing protein. (654 aa)
	A0A4Y8CRT2	HET domain-containing protein. (534 aa)
	A0A4Y8CRR5	HET domain-containing protein. (738 aa)
	A0A4Y8CQM0	HET domain-containing protein. (627 aa)
	A0A4Y8CP35	HET domain-containing protein. (669 aa)
	A0A4Y8CNP7	WW domain-containing protein. (704 aa)
	A0A4Y8CN49	HET domain-containing protein. (691 aa)
	A0A4Y8CLS7	Protein kinase domain-containing protein. (1295 aa)
	A0A4Y8CLF9	HET domain-containing protein. (473 aa)
	A0A4Y8CJJ8	Uncharacterized protein. (1396 aa)
	A0A4Y8CJ84	HET domain-containing protein. (558 aa)
	A0A4Y8D352	HET domain-containing protein. (183 aa)
	A0A4Y8CFY4	HET domain-containing protein. (397 aa)
	A0A4Y8CE70	HET domain-containing protein. (479 aa)
	A0A4Y8CCT0	HET domain-containing protein. (747 aa)
	A0A4Y8DKG1	HET domain-containing protein. (794 aa)
	A0A4Y8DIR2	HET domain-containing protein. (410 aa)
	A0A4Y8DI26	HET domain-containing protein. (575 aa)
	A0A4Y8DHY1	HET domain-containing protein. (153 aa)
	A0A4Y8DHR2	HET domain-containing protein. (819 aa)
	A0A4Y8DFH4	HET domain-containing protein. (451 aa)
	A0A4Y8DF49	HET domain-containing protein. (658 aa)
	A0A4Y8DCY6	HET domain-containing protein. (586 aa)
	A0A4Y8DBX0	HET domain-containing protein. (729 aa)
	A0A4Y8DBD3	HET domain-containing protein. (765 aa)
	A0A4Y8DAX6	HET domain-containing protein. (588 aa)
	A0A4Y8DAF5	HET domain-containing protein. (638 aa)
	A0A4Y8DAD5	HET domain-containing protein. (757 aa)
	A0A4Y8DA05	HET domain-containing protein. (707 aa)
	A0A4Y8D9B6	HET domain-containing protein. (1148 aa)
	A0A4Y8D896	ANK_REP_REGION domain-containing protein. (1520 aa)
	A0A4Y8D7W4	HET domain-containing protein. (611 aa)
	A0A4Y8D7R6	HET domain-containing protein. (726 aa)
	A0A4Y8D7N7	HET domain-containing protein. (1365 aa)
	A0A4Y8D671	HET domain-containing protein. (848 aa)
	A0A4Y8D647	HET domain-containing protein. (532 aa)
	A0A4Y8D5L2	HET domain-containing protein. (673 aa)
	A0A4Y8D5J8	HET domain-containing protein. (229 aa)
	A0A4Y8D383	HET domain-containing protein. (1089 aa)

Your Current Organism:

Botryotinia calthae

NCBI taxonomy Id: 38488
Other names: B. calthae, Botrytis calthae, Botrytis calthae Hennebert

Send network to Cytoscape

Export your current network:

... as a bitmap image:

download

file format is 'PNG': portable network graphic

... as a high-resolution bitmap:

download

same PNG format, but at higher resolution

... as a vector graphic:

download

SVG: scalable vector graphic - can be opened and edited in Illustrator, CorelDraw, Dia, etc

... as short tabular text output:

download

TSV: tab separated values - can be opened in Excel and Cytoscape (lists only one-way edges: A-B)

... as tabular text output:

download

TSV: tab separated values - can be opened in Excel (lists reciprocal edges: A-B,B-A)

... as an XML summary:

download

structured XML interaction data, according to the 'PSI-MI' data standard

... protein node degrees:

download

node degree of proteins in your network (given the current score cut-off)

... network coordinates:

download

a flat-file format describing the coordinates and colors of nodes in the network

... protein sequences:

download

MFA: multi-fasta format - containing the aminoacid sequences in the network

... protein annotations:

download

a tab-delimited file describing the names, domains and descriptions of proteins in your network

... functional annotations:

download

a tab-delimited file containing all known functional terms of proteins in your network

Browse interactions in tabular form:

node1	node2	node1 annotation	node2 annotation	score
A0A4Y8CE70	A0A4Y8CWF4	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.517
A0A4Y8CE70	A0A4Y8CZ88	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.574
A0A4Y8CE70	A0A4Y8D352	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.529
A0A4Y8CE70	A0A4Y8DAX6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.514
A0A4Y8CE70	A0A4Y8DIR2	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.465
A0A4Y8CIT6	A0A4Y8DFH4	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.487
A0A4Y8CJ84	A0A4Y8CQM0	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.407
A0A4Y8CJ84	A0A4Y8DAX6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.415
A0A4Y8CJJ8	A0A4Y8CLS7	Uncharacterized protein.	Protein kinase domain-containing protein.	0.743
A0A4Y8CLF9	A0A4Y8CWF4	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.420
A0A4Y8CLF9	A0A4Y8CZ88	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.495
A0A4Y8CLF9	A0A4Y8D7R6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.497
A0A4Y8CLF9	A0A4Y8DAX6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.402
A0A4Y8CLF9	A0A4Y8DFH4	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.496
A0A4Y8CLS7	A0A4Y8CJJ8	Protein kinase domain-containing protein.	Uncharacterized protein.	0.743
A0A4Y8CQM0	A0A4Y8CJ84	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.407
A0A4Y8CQM0	A0A4Y8DCY6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.407
A0A4Y8CRT2	A0A4Y8CWF4	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.429
A0A4Y8CRT2	A0A4Y8CZ88	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.516
A0A4Y8CRT2	A0A4Y8DAX6	HET domain-containing protein.	HET domain-containing protein.	0.418